Protein–RNA interactions for Protein: Q9P298

HIGD1B, HIG1 domain family member 1B, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD1BQ9P298 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
HIGD1BQ9P298 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
HIGD1BQ9P298 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms