Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVP2

ASF1B, Histone chaperone ASF1B, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASF1BQ9NVP2 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ASF1BQ9NVP2 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ASF1BQ9NVP2 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ASF1BQ9NVP2 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ASF1BQ9NVP2 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ASF1BQ9NVP2 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ASF1BQ9NVP2 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ASF1BQ9NVP2 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ASF1BQ9NVP2 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ASF1BQ9NVP2 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ASF1BQ9NVP2 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ASF1BQ9NVP2 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ASF1BQ9NVP2 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ASF1BQ9NVP2 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ASF1BQ9NVP2 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ASF1BQ9NVP2 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ASF1BQ9NVP2 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ASF1BQ9NVP2 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ASF1BQ9NVP2 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ASF1BQ9NVP2 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ASF1BQ9NVP2 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ASF1BQ9NVP2 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ASF1BQ9NVP2 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ASF1BQ9NVP2 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ASF1BQ9NVP2 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ASF1BQ9NVP2 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ASF1BQ9NVP2 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ASF1BQ9NVP2 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ASF1BQ9NVP2 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ASF1BQ9NVP2 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ASF1BQ9NVP2 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ASF1BQ9NVP2 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ASF1BQ9NVP2 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ASF1BQ9NVP2 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ASF1BQ9NVP2 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ASF1BQ9NVP2 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ASF1BQ9NVP2 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ASF1BQ9NVP2 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ASF1BQ9NVP2 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ASF1BQ9NVP2 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ASF1BQ9NVP2 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ASF1BQ9NVP2 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ASF1BQ9NVP2 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ASF1BQ9NVP2 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ASF1BQ9NVP2 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
ASF1BQ9NVP2 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ASF1BQ9NVP2 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ASF1BQ9NVP2 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ASF1BQ9NVP2 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ASF1BQ9NVP2 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ASF1BQ9NVP2 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ASF1BQ9NVP2 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ASF1BQ9NVP2 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ASF1BQ9NVP2 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ASF1BQ9NVP2 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ASF1BQ9NVP2 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ASF1BQ9NVP2 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ASF1BQ9NVP2 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ASF1BQ9NVP2 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ASF1BQ9NVP2 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ASF1BQ9NVP2 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ASF1BQ9NVP2 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ASF1BQ9NVP2 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ASF1BQ9NVP2 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ASF1BQ9NVP2 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ASF1BQ9NVP2 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ASF1BQ9NVP2 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ASF1BQ9NVP2 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ASF1BQ9NVP2 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ASF1BQ9NVP2 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ASF1BQ9NVP2 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ASF1BQ9NVP2 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ASF1BQ9NVP2 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ASF1BQ9NVP2 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ASF1BQ9NVP2 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ASF1BQ9NVP2 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ASF1BQ9NVP2 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ASF1BQ9NVP2 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ASF1BQ9NVP2 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ASF1BQ9NVP2 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ASF1BQ9NVP2 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ASF1BQ9NVP2 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ASF1BQ9NVP2 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ASF1BQ9NVP2 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ASF1BQ9NVP2 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ASF1BQ9NVP2 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ASF1BQ9NVP2 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ASF1BQ9NVP2 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ASF1BQ9NVP2 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ASF1BQ9NVP2 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ASF1BQ9NVP2 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ASF1BQ9NVP2 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ASF1BQ9NVP2 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ASF1BQ9NVP2 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ASF1BQ9NVP2 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ASF1BQ9NVP2 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ASF1BQ9NVP2 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ASF1BQ9NVP2 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ASF1BQ9NVP2 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ASF1BQ9NVP2 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms