Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSN8

SNTG1, Gamma-1-syntrophin, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTG1Q9NSN8 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms