Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC5

HOMER3, Homer protein homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOMER3Q9NSC5 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOMER3Q9NSC5 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOMER3Q9NSC5 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOMER3Q9NSC5 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOMER3Q9NSC5 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOMER3Q9NSC5 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOMER3Q9NSC5 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOMER3Q9NSC5 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOMER3Q9NSC5 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
HOMER3Q9NSC5 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOMER3Q9NSC5 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOMER3Q9NSC5 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOMER3Q9NSC5 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOMER3Q9NSC5 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
HOMER3Q9NSC5 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOMER3Q9NSC5 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOMER3Q9NSC5 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOMER3Q9NSC5 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOMER3Q9NSC5 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOMER3Q9NSC5 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOMER3Q9NSC5 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOMER3Q9NSC5 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOMER3Q9NSC5 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOMER3Q9NSC5 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOMER3Q9NSC5 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOMER3Q9NSC5 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOMER3Q9NSC5 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOMER3Q9NSC5 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOMER3Q9NSC5 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOMER3Q9NSC5 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOMER3Q9NSC5 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOMER3Q9NSC5 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOMER3Q9NSC5 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOMER3Q9NSC5 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOMER3Q9NSC5 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOMER3Q9NSC5 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOMER3Q9NSC5 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOMER3Q9NSC5 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOMER3Q9NSC5 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOMER3Q9NSC5 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOMER3Q9NSC5 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOMER3Q9NSC5 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOMER3Q9NSC5 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOMER3Q9NSC5 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOMER3Q9NSC5 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOMER3Q9NSC5 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOMER3Q9NSC5 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOMER3Q9NSC5 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOMER3Q9NSC5 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOMER3Q9NSC5 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOMER3Q9NSC5 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOMER3Q9NSC5 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOMER3Q9NSC5 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOMER3Q9NSC5 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOMER3Q9NSC5 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
HOMER3Q9NSC5 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOMER3Q9NSC5 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOMER3Q9NSC5 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOMER3Q9NSC5 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOMER3Q9NSC5 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
HOMER3Q9NSC5 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
HOMER3Q9NSC5 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HOMER3Q9NSC5 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
HOMER3Q9NSC5 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
HOMER3Q9NSC5 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOMER3Q9NSC5 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOMER3Q9NSC5 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOMER3Q9NSC5 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOMER3Q9NSC5 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOMER3Q9NSC5 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOMER3Q9NSC5 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOMER3Q9NSC5 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOMER3Q9NSC5 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOMER3Q9NSC5 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOMER3Q9NSC5 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOMER3Q9NSC5 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOMER3Q9NSC5 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOMER3Q9NSC5 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOMER3Q9NSC5 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOMER3Q9NSC5 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOMER3Q9NSC5 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOMER3Q9NSC5 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOMER3Q9NSC5 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOMER3Q9NSC5 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOMER3Q9NSC5 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOMER3Q9NSC5 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOMER3Q9NSC5 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
HOMER3Q9NSC5 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOMER3Q9NSC5 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOMER3Q9NSC5 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOMER3Q9NSC5 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOMER3Q9NSC5 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOMER3Q9NSC5 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOMER3Q9NSC5 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOMER3Q9NSC5 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOMER3Q9NSC5 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOMER3Q9NSC5 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOMER3Q9NSC5 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOMER3Q9NSC5 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOMER3Q9NSC5 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms