Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPW4

APOL4, Apolipoprotein L4, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOL4Q9BPW4 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOL4Q9BPW4 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
APOL4Q9BPW4 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
APOL4Q9BPW4 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
APOL4Q9BPW4 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
APOL4Q9BPW4 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
APOL4Q9BPW4 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOL4Q9BPW4 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOL4Q9BPW4 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOL4Q9BPW4 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOL4Q9BPW4 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOL4Q9BPW4 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
APOL4Q9BPW4 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOL4Q9BPW4 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOL4Q9BPW4 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOL4Q9BPW4 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOL4Q9BPW4 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOL4Q9BPW4 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOL4Q9BPW4 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOL4Q9BPW4 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOL4Q9BPW4 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOL4Q9BPW4 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
APOL4Q9BPW4 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
APOL4Q9BPW4 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOL4Q9BPW4 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOL4Q9BPW4 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOL4Q9BPW4 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
APOL4Q9BPW4 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOL4Q9BPW4 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOL4Q9BPW4 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOL4Q9BPW4 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOL4Q9BPW4 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOL4Q9BPW4 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOL4Q9BPW4 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOL4Q9BPW4 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOL4Q9BPW4 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOL4Q9BPW4 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOL4Q9BPW4 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOL4Q9BPW4 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOL4Q9BPW4 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOL4Q9BPW4 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOL4Q9BPW4 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOL4Q9BPW4 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms