Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN2

CCDC136, Coiled-coil domain-containing protein 136, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC136Q96JN2 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC136Q96JN2 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC136Q96JN2 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC136Q96JN2 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC136Q96JN2 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC136Q96JN2 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC136Q96JN2 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC136Q96JN2 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC136Q96JN2 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC136Q96JN2 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC136Q96JN2 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC136Q96JN2 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC136Q96JN2 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC136Q96JN2 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC136Q96JN2 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC136Q96JN2 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC136Q96JN2 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC136Q96JN2 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC136Q96JN2 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC136Q96JN2 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC136Q96JN2 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC136Q96JN2 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC136Q96JN2 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC136Q96JN2 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC136Q96JN2 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC136Q96JN2 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC136Q96JN2 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC136Q96JN2 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC136Q96JN2 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC136Q96JN2 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC136Q96JN2 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC136Q96JN2 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC136Q96JN2 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC136Q96JN2 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC136Q96JN2 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC136Q96JN2 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC136Q96JN2 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC136Q96JN2 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC136Q96JN2 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC136Q96JN2 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC136Q96JN2 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC136Q96JN2 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC136Q96JN2 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC136Q96JN2 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC136Q96JN2 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC136Q96JN2 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC136Q96JN2 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC136Q96JN2 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC136Q96JN2 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC136Q96JN2 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC136Q96JN2 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC136Q96JN2 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC136Q96JN2 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC136Q96JN2 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC136Q96JN2 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC136Q96JN2 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC136Q96JN2 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC136Q96JN2 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC136Q96JN2 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC136Q96JN2 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC136Q96JN2 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC136Q96JN2 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC136Q96JN2 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC136Q96JN2 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC136Q96JN2 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC136Q96JN2 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC136Q96JN2 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC136Q96JN2 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC136Q96JN2 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC136Q96JN2 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC136Q96JN2 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC136Q96JN2 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC136Q96JN2 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC136Q96JN2 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC136Q96JN2 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC136Q96JN2 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC136Q96JN2 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC136Q96JN2 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC136Q96JN2 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC136Q96JN2 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC136Q96JN2 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC136Q96JN2 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC136Q96JN2 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC136Q96JN2 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC136Q96JN2 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC136Q96JN2 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC136Q96JN2 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC136Q96JN2 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC136Q96JN2 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC136Q96JN2 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC136Q96JN2 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC136Q96JN2 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC136Q96JN2 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC136Q96JN2 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC136Q96JN2 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC136Q96JN2 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC136Q96JN2 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC136Q96JN2 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC136Q96JN2 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC136Q96JN2 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms