Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZU67

BEND4, BEN domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEND4Q6ZU67 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BEND4Q6ZU67 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BEND4Q6ZU67 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BEND4Q6ZU67 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BEND4Q6ZU67 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BEND4Q6ZU67 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BEND4Q6ZU67 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BEND4Q6ZU67 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BEND4Q6ZU67 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BEND4Q6ZU67 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BEND4Q6ZU67 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BEND4Q6ZU67 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
BEND4Q6ZU67 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BEND4Q6ZU67 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BEND4Q6ZU67 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BEND4Q6ZU67 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BEND4Q6ZU67 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BEND4Q6ZU67 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BEND4Q6ZU67 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BEND4Q6ZU67 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BEND4Q6ZU67 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BEND4Q6ZU67 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BEND4Q6ZU67 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BEND4Q6ZU67 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BEND4Q6ZU67 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BEND4Q6ZU67 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BEND4Q6ZU67 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BEND4Q6ZU67 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BEND4Q6ZU67 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BEND4Q6ZU67 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
BEND4Q6ZU67 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
BEND4Q6ZU67 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
BEND4Q6ZU67 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BEND4Q6ZU67 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BEND4Q6ZU67 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
BEND4Q6ZU67 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BEND4Q6ZU67 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BEND4Q6ZU67 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BEND4Q6ZU67 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BEND4Q6ZU67 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BEND4Q6ZU67 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BEND4Q6ZU67 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BEND4Q6ZU67 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BEND4Q6ZU67 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BEND4Q6ZU67 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BEND4Q6ZU67 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BEND4Q6ZU67 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BEND4Q6ZU67 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BEND4Q6ZU67 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BEND4Q6ZU67 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BEND4Q6ZU67 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BEND4Q6ZU67 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BEND4Q6ZU67 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BEND4Q6ZU67 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BEND4Q6ZU67 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BEND4Q6ZU67 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BEND4Q6ZU67 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BEND4Q6ZU67 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BEND4Q6ZU67 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BEND4Q6ZU67 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BEND4Q6ZU67 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BEND4Q6ZU67 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BEND4Q6ZU67 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BEND4Q6ZU67 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BEND4Q6ZU67 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BEND4Q6ZU67 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
BEND4Q6ZU67 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BEND4Q6ZU67 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BEND4Q6ZU67 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BEND4Q6ZU67 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
BEND4Q6ZU67 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BEND4Q6ZU67 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BEND4Q6ZU67 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BEND4Q6ZU67 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BEND4Q6ZU67 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
BEND4Q6ZU67 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BEND4Q6ZU67 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BEND4Q6ZU67 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BEND4Q6ZU67 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BEND4Q6ZU67 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
BEND4Q6ZU67 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BEND4Q6ZU67 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BEND4Q6ZU67 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BEND4Q6ZU67 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BEND4Q6ZU67 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BEND4Q6ZU67 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BEND4Q6ZU67 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BEND4Q6ZU67 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BEND4Q6ZU67 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BEND4Q6ZU67 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BEND4Q6ZU67 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BEND4Q6ZU67 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BEND4Q6ZU67 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BEND4Q6ZU67 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BEND4Q6ZU67 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
BEND4Q6ZU67 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BEND4Q6ZU67 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BEND4Q6ZU67 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BEND4Q6ZU67 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BEND4Q6ZU67 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms