Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT2

H3F3C, Histone H3.3C, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3F3CQ6NXT2 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
H3F3CQ6NXT2 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
H3F3CQ6NXT2 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H3F3CQ6NXT2 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
H3F3CQ6NXT2 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
H3F3CQ6NXT2 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
H3F3CQ6NXT2 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
H3F3CQ6NXT2 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H3F3CQ6NXT2 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H3F3CQ6NXT2 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H3F3CQ6NXT2 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H3F3CQ6NXT2 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
H3F3CQ6NXT2 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
H3F3CQ6NXT2 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
H3F3CQ6NXT2 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
H3F3CQ6NXT2 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H3F3CQ6NXT2 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H3F3CQ6NXT2 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H3F3CQ6NXT2 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H3F3CQ6NXT2 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H3F3CQ6NXT2 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H3F3CQ6NXT2 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H3F3CQ6NXT2 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H3F3CQ6NXT2 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H3F3CQ6NXT2 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H3F3CQ6NXT2 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
H3F3CQ6NXT2 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
H3F3CQ6NXT2 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H3F3CQ6NXT2 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
H3F3CQ6NXT2 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
H3F3CQ6NXT2 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
H3F3CQ6NXT2 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
H3F3CQ6NXT2 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
H3F3CQ6NXT2 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
H3F3CQ6NXT2 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
H3F3CQ6NXT2 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
H3F3CQ6NXT2 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
H3F3CQ6NXT2 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
H3F3CQ6NXT2 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H3F3CQ6NXT2 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H3F3CQ6NXT2 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H3F3CQ6NXT2 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H3F3CQ6NXT2 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
H3F3CQ6NXT2 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H3F3CQ6NXT2 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
H3F3CQ6NXT2 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
H3F3CQ6NXT2 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
H3F3CQ6NXT2 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
H3F3CQ6NXT2 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
H3F3CQ6NXT2 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
H3F3CQ6NXT2 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H3F3CQ6NXT2 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
H3F3CQ6NXT2 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
H3F3CQ6NXT2 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
H3F3CQ6NXT2 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H3F3CQ6NXT2 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H3F3CQ6NXT2 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H3F3CQ6NXT2 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H3F3CQ6NXT2 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H3F3CQ6NXT2 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H3F3CQ6NXT2 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H3F3CQ6NXT2 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
H3F3CQ6NXT2 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
H3F3CQ6NXT2 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
H3F3CQ6NXT2 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
H3F3CQ6NXT2 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
H3F3CQ6NXT2 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
H3F3CQ6NXT2 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
H3F3CQ6NXT2 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
H3F3CQ6NXT2 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
H3F3CQ6NXT2 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
H3F3CQ6NXT2 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
H3F3CQ6NXT2 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
H3F3CQ6NXT2 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
H3F3CQ6NXT2 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
H3F3CQ6NXT2 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
H3F3CQ6NXT2 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
H3F3CQ6NXT2 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
H3F3CQ6NXT2 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
H3F3CQ6NXT2 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H3F3CQ6NXT2 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H3F3CQ6NXT2 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H3F3CQ6NXT2 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H3F3CQ6NXT2 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
H3F3CQ6NXT2 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
H3F3CQ6NXT2 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H3F3CQ6NXT2 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H3F3CQ6NXT2 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H3F3CQ6NXT2 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H3F3CQ6NXT2 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
H3F3CQ6NXT2 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H3F3CQ6NXT2 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H3F3CQ6NXT2 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
H3F3CQ6NXT2 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H3F3CQ6NXT2 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H3F3CQ6NXT2 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H3F3CQ6NXT2 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
H3F3CQ6NXT2 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
H3F3CQ6NXT2 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
H3F3CQ6NXT2 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms