Protein–RNA interactions for Protein: Q5T7P8

SYT6, Synaptotagmin-6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT6Q5T7P8 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYT6Q5T7P8 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYT6Q5T7P8 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYT6Q5T7P8 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SYT6Q5T7P8 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYT6Q5T7P8 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYT6Q5T7P8 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYT6Q5T7P8 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYT6Q5T7P8 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYT6Q5T7P8 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYT6Q5T7P8 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYT6Q5T7P8 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYT6Q5T7P8 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYT6Q5T7P8 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYT6Q5T7P8 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYT6Q5T7P8 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYT6Q5T7P8 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYT6Q5T7P8 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYT6Q5T7P8 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SYT6Q5T7P8 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYT6Q5T7P8 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYT6Q5T7P8 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYT6Q5T7P8 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYT6Q5T7P8 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYT6Q5T7P8 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYT6Q5T7P8 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYT6Q5T7P8 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYT6Q5T7P8 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYT6Q5T7P8 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYT6Q5T7P8 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYT6Q5T7P8 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYT6Q5T7P8 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYT6Q5T7P8 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYT6Q5T7P8 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYT6Q5T7P8 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SYT6Q5T7P8 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYT6Q5T7P8 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SYT6Q5T7P8 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYT6Q5T7P8 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SYT6Q5T7P8 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYT6Q5T7P8 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYT6Q5T7P8 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYT6Q5T7P8 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYT6Q5T7P8 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYT6Q5T7P8 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYT6Q5T7P8 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYT6Q5T7P8 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYT6Q5T7P8 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYT6Q5T7P8 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYT6Q5T7P8 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYT6Q5T7P8 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYT6Q5T7P8 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SYT6Q5T7P8 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYT6Q5T7P8 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYT6Q5T7P8 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYT6Q5T7P8 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYT6Q5T7P8 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYT6Q5T7P8 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYT6Q5T7P8 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYT6Q5T7P8 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYT6Q5T7P8 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYT6Q5T7P8 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYT6Q5T7P8 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYT6Q5T7P8 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYT6Q5T7P8 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYT6Q5T7P8 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYT6Q5T7P8 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYT6Q5T7P8 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYT6Q5T7P8 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYT6Q5T7P8 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYT6Q5T7P8 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYT6Q5T7P8 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYT6Q5T7P8 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYT6Q5T7P8 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYT6Q5T7P8 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYT6Q5T7P8 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYT6Q5T7P8 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYT6Q5T7P8 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYT6Q5T7P8 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYT6Q5T7P8 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYT6Q5T7P8 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYT6Q5T7P8 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYT6Q5T7P8 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYT6Q5T7P8 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYT6Q5T7P8 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYT6Q5T7P8 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SYT6Q5T7P8 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SYT6Q5T7P8 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SYT6Q5T7P8 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SYT6Q5T7P8 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SYT6Q5T7P8 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SYT6Q5T7P8 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SYT6Q5T7P8 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SYT6Q5T7P8 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SYT6Q5T7P8 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SYT6Q5T7P8 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SYT6Q5T7P8 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SYT6Q5T7P8 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SYT6Q5T7P8 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SYT6Q5T7P8 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms