Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SP6Q3SY56 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SP6Q3SY56 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SP6Q3SY56 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SP6Q3SY56 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SP6Q3SY56 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SP6Q3SY56 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SP6Q3SY56 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SP6Q3SY56 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SP6Q3SY56 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SP6Q3SY56 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SP6Q3SY56 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
SP6Q3SY56 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SP6Q3SY56 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
SP6Q3SY56 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SP6Q3SY56 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SP6Q3SY56 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SP6Q3SY56 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SP6Q3SY56 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SP6Q3SY56 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
SP6Q3SY56 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SP6Q3SY56 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SP6Q3SY56 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SP6Q3SY56 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SP6Q3SY56 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SP6Q3SY56 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SP6Q3SY56 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SP6Q3SY56 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SP6Q3SY56 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SP6Q3SY56 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SP6Q3SY56 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SP6Q3SY56 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SP6Q3SY56 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SP6Q3SY56 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SP6Q3SY56 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SP6Q3SY56 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SP6Q3SY56 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SP6Q3SY56 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SP6Q3SY56 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SP6Q3SY56 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SP6Q3SY56 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SP6Q3SY56 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SP6Q3SY56 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SP6Q3SY56 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SP6Q3SY56 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SP6Q3SY56 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SP6Q3SY56 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SP6Q3SY56 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SP6Q3SY56 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SP6Q3SY56 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SP6Q3SY56 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SP6Q3SY56 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SP6Q3SY56 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SP6Q3SY56 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SP6Q3SY56 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SP6Q3SY56 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SP6Q3SY56 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SP6Q3SY56 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SP6Q3SY56 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SP6Q3SY56 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SP6Q3SY56 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SP6Q3SY56 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SP6Q3SY56 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SP6Q3SY56 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SP6Q3SY56 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SP6Q3SY56 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SP6Q3SY56 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SP6Q3SY56 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SP6Q3SY56 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
SP6Q3SY56 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SP6Q3SY56 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SP6Q3SY56 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
SP6Q3SY56 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SP6Q3SY56 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SP6Q3SY56 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SP6Q3SY56 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SP6Q3SY56 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SP6Q3SY56 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SP6Q3SY56 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SP6Q3SY56 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SP6Q3SY56 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
SP6Q3SY56 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SP6Q3SY56 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SP6Q3SY56 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SP6Q3SY56 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SP6Q3SY56 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
SP6Q3SY56 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
SP6Q3SY56 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SP6Q3SY56 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SP6Q3SY56 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SP6Q3SY56 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SP6Q3SY56 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SP6Q3SY56 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SP6Q3SY56 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SP6Q3SY56 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SP6Q3SY56 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SP6Q3SY56 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SP6Q3SY56 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SP6Q3SY56 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SP6Q3SY56 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
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