Protein–RNA interactions for Protein: Q15835

GRK1, Rhodopsin kinase, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRK1Q15835 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRK1Q15835 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRK1Q15835 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRK1Q15835 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRK1Q15835 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRK1Q15835 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRK1Q15835 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRK1Q15835 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRK1Q15835 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRK1Q15835 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRK1Q15835 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRK1Q15835 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRK1Q15835 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRK1Q15835 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRK1Q15835 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRK1Q15835 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRK1Q15835 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRK1Q15835 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRK1Q15835 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRK1Q15835 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRK1Q15835 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRK1Q15835 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRK1Q15835 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRK1Q15835 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRK1Q15835 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRK1Q15835 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRK1Q15835 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRK1Q15835 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRK1Q15835 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GRK1Q15835 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRK1Q15835 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRK1Q15835 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRK1Q15835 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRK1Q15835 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRK1Q15835 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRK1Q15835 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GRK1Q15835 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRK1Q15835 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRK1Q15835 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRK1Q15835 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRK1Q15835 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRK1Q15835 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRK1Q15835 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRK1Q15835 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRK1Q15835 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRK1Q15835 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRK1Q15835 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRK1Q15835 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRK1Q15835 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRK1Q15835 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRK1Q15835 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRK1Q15835 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRK1Q15835 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GRK1Q15835 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GRK1Q15835 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GRK1Q15835 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GRK1Q15835 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GRK1Q15835 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GRK1Q15835 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GRK1Q15835 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GRK1Q15835 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GRK1Q15835 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GRK1Q15835 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GRK1Q15835 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GRK1Q15835 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GRK1Q15835 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GRK1Q15835 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GRK1Q15835 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GRK1Q15835 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GRK1Q15835 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GRK1Q15835 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GRK1Q15835 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GRK1Q15835 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GRK1Q15835 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GRK1Q15835 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GRK1Q15835 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GRK1Q15835 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GRK1Q15835 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GRK1Q15835 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GRK1Q15835 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GRK1Q15835 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GRK1Q15835 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GRK1Q15835 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GRK1Q15835 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GRK1Q15835 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GRK1Q15835 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GRK1Q15835 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GRK1Q15835 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GRK1Q15835 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GRK1Q15835 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GRK1Q15835 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GRK1Q15835 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GRK1Q15835 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GRK1Q15835 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GRK1Q15835 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GRK1Q15835 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GRK1Q15835 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GRK1Q15835 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GRK1Q15835 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GRK1Q15835 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms