Protein–RNA interactions for Protein: Q15223

NECTIN1, Nectin-1, humanhuman

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN1Q15223 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NECTIN1Q15223 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NECTIN1Q15223 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
NECTIN1Q15223 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NECTIN1Q15223 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NECTIN1Q15223 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NECTIN1Q15223 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NECTIN1Q15223 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NECTIN1Q15223 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NECTIN1Q15223 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NECTIN1Q15223 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NECTIN1Q15223 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NECTIN1Q15223 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NECTIN1Q15223 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NECTIN1Q15223 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NECTIN1Q15223 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NECTIN1Q15223 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NECTIN1Q15223 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NECTIN1Q15223 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NECTIN1Q15223 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NECTIN1Q15223 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NECTIN1Q15223 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NECTIN1Q15223 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
NECTIN1Q15223 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NECTIN1Q15223 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NECTIN1Q15223 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NECTIN1Q15223 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NECTIN1Q15223 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NECTIN1Q15223 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NECTIN1Q15223 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NECTIN1Q15223 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NECTIN1Q15223 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NECTIN1Q15223 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NECTIN1Q15223 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NECTIN1Q15223 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NECTIN1Q15223 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NECTIN1Q15223 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NECTIN1Q15223 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NECTIN1Q15223 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NECTIN1Q15223 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NECTIN1Q15223 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NECTIN1Q15223 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NECTIN1Q15223 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NECTIN1Q15223 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NECTIN1Q15223 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NECTIN1Q15223 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NECTIN1Q15223 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NECTIN1Q15223 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NECTIN1Q15223 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NECTIN1Q15223 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NECTIN1Q15223 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NECTIN1Q15223 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NECTIN1Q15223 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NECTIN1Q15223 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NECTIN1Q15223 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NECTIN1Q15223 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NECTIN1Q15223 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NECTIN1Q15223 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NECTIN1Q15223 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NECTIN1Q15223 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NECTIN1Q15223 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NECTIN1Q15223 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NECTIN1Q15223 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NECTIN1Q15223 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NECTIN1Q15223 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
NECTIN1Q15223 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NECTIN1Q15223 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NECTIN1Q15223 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NECTIN1Q15223 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NECTIN1Q15223 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NECTIN1Q15223 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NECTIN1Q15223 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NECTIN1Q15223 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NECTIN1Q15223 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NECTIN1Q15223 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NECTIN1Q15223 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NECTIN1Q15223 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NECTIN1Q15223 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
NECTIN1Q15223 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NECTIN1Q15223 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NECTIN1Q15223 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NECTIN1Q15223 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NECTIN1Q15223 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NECTIN1Q15223 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NECTIN1Q15223 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NECTIN1Q15223 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NECTIN1Q15223 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NECTIN1Q15223 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NECTIN1Q15223 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NECTIN1Q15223 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NECTIN1Q15223 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NECTIN1Q15223 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NECTIN1Q15223 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NECTIN1Q15223 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NECTIN1Q15223 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NECTIN1Q15223 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NECTIN1Q15223 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NECTIN1Q15223 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NECTIN1Q15223 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NECTIN1Q15223 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
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