Protein–RNA interactions for Protein: Q13639

HTR4, 5-hydroxytryptamine receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR4Q13639 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HTR4Q13639 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HTR4Q13639 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HTR4Q13639 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HTR4Q13639 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HTR4Q13639 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HTR4Q13639 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HTR4Q13639 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HTR4Q13639 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HTR4Q13639 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HTR4Q13639 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HTR4Q13639 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HTR4Q13639 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HTR4Q13639 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HTR4Q13639 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HTR4Q13639 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HTR4Q13639 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HTR4Q13639 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HTR4Q13639 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HTR4Q13639 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HTR4Q13639 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HTR4Q13639 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
HTR4Q13639 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HTR4Q13639 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
HTR4Q13639 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HTR4Q13639 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HTR4Q13639 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HTR4Q13639 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HTR4Q13639 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HTR4Q13639 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
HTR4Q13639 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HTR4Q13639 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HTR4Q13639 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HTR4Q13639 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HTR4Q13639 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HTR4Q13639 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HTR4Q13639 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HTR4Q13639 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HTR4Q13639 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HTR4Q13639 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HTR4Q13639 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HTR4Q13639 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HTR4Q13639 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
HTR4Q13639 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HTR4Q13639 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HTR4Q13639 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HTR4Q13639 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HTR4Q13639 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HTR4Q13639 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HTR4Q13639 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HTR4Q13639 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HTR4Q13639 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
HTR4Q13639 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HTR4Q13639 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HTR4Q13639 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HTR4Q13639 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HTR4Q13639 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HTR4Q13639 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HTR4Q13639 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HTR4Q13639 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HTR4Q13639 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HTR4Q13639 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HTR4Q13639 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HTR4Q13639 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HTR4Q13639 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HTR4Q13639 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HTR4Q13639 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HTR4Q13639 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HTR4Q13639 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HTR4Q13639 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HTR4Q13639 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HTR4Q13639 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HTR4Q13639 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HTR4Q13639 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HTR4Q13639 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HTR4Q13639 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HTR4Q13639 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HTR4Q13639 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HTR4Q13639 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HTR4Q13639 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HTR4Q13639 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
HTR4Q13639 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HTR4Q13639 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HTR4Q13639 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HTR4Q13639 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HTR4Q13639 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
HTR4Q13639 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
HTR4Q13639 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
HTR4Q13639 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
HTR4Q13639 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
HTR4Q13639 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
HTR4Q13639 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
HTR4Q13639 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HTR4Q13639 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HTR4Q13639 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HTR4Q13639 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HTR4Q13639 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HTR4Q13639 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HTR4Q13639 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HTR4Q13639 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
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