Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CUL3Q13618 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CUL3Q13618 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CUL3Q13618 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CUL3Q13618 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CUL3Q13618 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CUL3Q13618 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CUL3Q13618 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CUL3Q13618 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CUL3Q13618 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CUL3Q13618 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CUL3Q13618 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CUL3Q13618 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CUL3Q13618 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CUL3Q13618 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CUL3Q13618 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CUL3Q13618 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CUL3Q13618 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CUL3Q13618 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CUL3Q13618 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CUL3Q13618 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CUL3Q13618 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CUL3Q13618 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CUL3Q13618 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CUL3Q13618 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CUL3Q13618 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CUL3Q13618 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CUL3Q13618 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CUL3Q13618 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CUL3Q13618 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CUL3Q13618 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CUL3Q13618 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CUL3Q13618 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CUL3Q13618 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CUL3Q13618 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
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