Protein–RNA interactions for Protein: Q12908

SLC10A2, Ileal sodium/bile acid cotransporter, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A2Q12908 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC10A2Q12908 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC10A2Q12908 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC10A2Q12908 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC10A2Q12908 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC10A2Q12908 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC10A2Q12908 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC10A2Q12908 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC10A2Q12908 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC10A2Q12908 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC10A2Q12908 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC10A2Q12908 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC10A2Q12908 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC10A2Q12908 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC10A2Q12908 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC10A2Q12908 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC10A2Q12908 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC10A2Q12908 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC10A2Q12908 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC10A2Q12908 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC10A2Q12908 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC10A2Q12908 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC10A2Q12908 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC10A2Q12908 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC10A2Q12908 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC10A2Q12908 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC10A2Q12908 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC10A2Q12908 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC10A2Q12908 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC10A2Q12908 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC10A2Q12908 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC10A2Q12908 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC10A2Q12908 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC10A2Q12908 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC10A2Q12908 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC10A2Q12908 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC10A2Q12908 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC10A2Q12908 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC10A2Q12908 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC10A2Q12908 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC10A2Q12908 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC10A2Q12908 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC10A2Q12908 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC10A2Q12908 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC10A2Q12908 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC10A2Q12908 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC10A2Q12908 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC10A2Q12908 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC10A2Q12908 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC10A2Q12908 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC10A2Q12908 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC10A2Q12908 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC10A2Q12908 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC10A2Q12908 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC10A2Q12908 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC10A2Q12908 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC10A2Q12908 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC10A2Q12908 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC10A2Q12908 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC10A2Q12908 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC10A2Q12908 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC10A2Q12908 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC10A2Q12908 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC10A2Q12908 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC10A2Q12908 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC10A2Q12908 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC10A2Q12908 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC10A2Q12908 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC10A2Q12908 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC10A2Q12908 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC10A2Q12908 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC10A2Q12908 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC10A2Q12908 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC10A2Q12908 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC10A2Q12908 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC10A2Q12908 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC10A2Q12908 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC10A2Q12908 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC10A2Q12908 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC10A2Q12908 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC10A2Q12908 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC10A2Q12908 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC10A2Q12908 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC10A2Q12908 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC10A2Q12908 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC10A2Q12908 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC10A2Q12908 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC10A2Q12908 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC10A2Q12908 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC10A2Q12908 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC10A2Q12908 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC10A2Q12908 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC10A2Q12908 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC10A2Q12908 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC10A2Q12908 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC10A2Q12908 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC10A2Q12908 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC10A2Q12908 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC10A2Q12908 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC10A2Q12908 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms