Protein–RNA interactions for Protein: P67870

CSNK2B, Casein kinase II subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2BP67870 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSNK2BP67870 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSNK2BP67870 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSNK2BP67870 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSNK2BP67870 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSNK2BP67870 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSNK2BP67870 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSNK2BP67870 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSNK2BP67870 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSNK2BP67870 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSNK2BP67870 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSNK2BP67870 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSNK2BP67870 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSNK2BP67870 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSNK2BP67870 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSNK2BP67870 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSNK2BP67870 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CSNK2BP67870 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSNK2BP67870 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSNK2BP67870 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CSNK2BP67870 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CSNK2BP67870 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSNK2BP67870 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSNK2BP67870 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSNK2BP67870 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSNK2BP67870 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSNK2BP67870 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSNK2BP67870 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSNK2BP67870 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSNK2BP67870 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSNK2BP67870 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSNK2BP67870 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSNK2BP67870 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSNK2BP67870 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSNK2BP67870 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSNK2BP67870 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSNK2BP67870 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSNK2BP67870 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSNK2BP67870 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSNK2BP67870 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSNK2BP67870 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSNK2BP67870 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSNK2BP67870 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSNK2BP67870 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSNK2BP67870 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSNK2BP67870 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CSNK2BP67870 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSNK2BP67870 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSNK2BP67870 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSNK2BP67870 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSNK2BP67870 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSNK2BP67870 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSNK2BP67870 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CSNK2BP67870 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CSNK2BP67870 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSNK2BP67870 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSNK2BP67870 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSNK2BP67870 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CSNK2BP67870 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSNK2BP67870 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSNK2BP67870 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSNK2BP67870 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSNK2BP67870 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CSNK2BP67870 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSNK2BP67870 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSNK2BP67870 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSNK2BP67870 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSNK2BP67870 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSNK2BP67870 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSNK2BP67870 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSNK2BP67870 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CSNK2BP67870 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSNK2BP67870 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSNK2BP67870 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSNK2BP67870 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSNK2BP67870 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSNK2BP67870 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSNK2BP67870 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSNK2BP67870 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSNK2BP67870 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSNK2BP67870 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSNK2BP67870 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSNK2BP67870 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSNK2BP67870 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSNK2BP67870 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSNK2BP67870 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSNK2BP67870 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSNK2BP67870 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSNK2BP67870 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSNK2BP67870 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSNK2BP67870 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSNK2BP67870 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSNK2BP67870 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSNK2BP67870 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSNK2BP67870 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSNK2BP67870 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSNK2BP67870 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSNK2BP67870 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSNK2BP67870 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSNK2BP67870 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms