Protein–RNA interactions for Protein: P51587

BRCA2, Breast cancer type 2 susceptibility protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCA2P51587 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
BRCA2P51587 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
BRCA2P51587 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
BRCA2P51587 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
BRCA2P51587 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
BRCA2P51587 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
BRCA2P51587 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
BRCA2P51587 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BRCA2P51587 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BRCA2P51587 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
BRCA2P51587 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BRCA2P51587 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BRCA2P51587 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
BRCA2P51587 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
BRCA2P51587 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
BRCA2P51587 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
BRCA2P51587 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BRCA2P51587 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BRCA2P51587 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BRCA2P51587 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BRCA2P51587 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
BRCA2P51587 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BRCA2P51587 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BRCA2P51587 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
BRCA2P51587 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BRCA2P51587 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
BRCA2P51587 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BRCA2P51587 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BRCA2P51587 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BRCA2P51587 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BRCA2P51587 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BRCA2P51587 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BRCA2P51587 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BRCA2P51587 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
BRCA2P51587 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BRCA2P51587 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BRCA2P51587 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BRCA2P51587 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BRCA2P51587 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BRCA2P51587 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BRCA2P51587 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
BRCA2P51587 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BRCA2P51587 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BRCA2P51587 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BRCA2P51587 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BRCA2P51587 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BRCA2P51587 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BRCA2P51587 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BRCA2P51587 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BRCA2P51587 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BRCA2P51587 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BRCA2P51587 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BRCA2P51587 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BRCA2P51587 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BRCA2P51587 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BRCA2P51587 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BRCA2P51587 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BRCA2P51587 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BRCA2P51587 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BRCA2P51587 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BRCA2P51587 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BRCA2P51587 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BRCA2P51587 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BRCA2P51587 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
BRCA2P51587 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BRCA2P51587 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BRCA2P51587 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BRCA2P51587 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BRCA2P51587 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BRCA2P51587 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BRCA2P51587 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BRCA2P51587 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BRCA2P51587 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
BRCA2P51587 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BRCA2P51587 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BRCA2P51587 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
BRCA2P51587 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BRCA2P51587 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BRCA2P51587 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BRCA2P51587 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BRCA2P51587 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BRCA2P51587 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BRCA2P51587 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
BRCA2P51587 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BRCA2P51587 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
BRCA2P51587 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
BRCA2P51587 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
BRCA2P51587 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
BRCA2P51587 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
BRCA2P51587 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
BRCA2P51587 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
BRCA2P51587 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
BRCA2P51587 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
BRCA2P51587 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
BRCA2P51587 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BRCA2P51587 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BRCA2P51587 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BRCA2P51587 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BRCA2P51587 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BRCA2P51587 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms