Protein–RNA interactions for Protein: P48995

TRPC1, Short transient receptor potential channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC1P48995 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRPC1P48995 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRPC1P48995 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRPC1P48995 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRPC1P48995 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRPC1P48995 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TRPC1P48995 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRPC1P48995 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TRPC1P48995 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRPC1P48995 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRPC1P48995 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRPC1P48995 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRPC1P48995 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRPC1P48995 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRPC1P48995 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRPC1P48995 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRPC1P48995 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRPC1P48995 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRPC1P48995 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRPC1P48995 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRPC1P48995 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRPC1P48995 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRPC1P48995 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRPC1P48995 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRPC1P48995 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TRPC1P48995 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRPC1P48995 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRPC1P48995 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRPC1P48995 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRPC1P48995 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRPC1P48995 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRPC1P48995 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRPC1P48995 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRPC1P48995 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRPC1P48995 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TRPC1P48995 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRPC1P48995 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRPC1P48995 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRPC1P48995 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRPC1P48995 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRPC1P48995 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRPC1P48995 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRPC1P48995 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRPC1P48995 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRPC1P48995 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRPC1P48995 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRPC1P48995 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRPC1P48995 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRPC1P48995 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRPC1P48995 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRPC1P48995 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRPC1P48995 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRPC1P48995 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRPC1P48995 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRPC1P48995 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRPC1P48995 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRPC1P48995 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRPC1P48995 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRPC1P48995 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRPC1P48995 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRPC1P48995 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRPC1P48995 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRPC1P48995 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRPC1P48995 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRPC1P48995 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRPC1P48995 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRPC1P48995 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRPC1P48995 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRPC1P48995 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRPC1P48995 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRPC1P48995 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRPC1P48995 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRPC1P48995 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRPC1P48995 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TRPC1P48995 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRPC1P48995 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRPC1P48995 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TRPC1P48995 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRPC1P48995 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRPC1P48995 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRPC1P48995 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRPC1P48995 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRPC1P48995 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRPC1P48995 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRPC1P48995 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRPC1P48995 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRPC1P48995 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRPC1P48995 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRPC1P48995 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRPC1P48995 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRPC1P48995 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRPC1P48995 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRPC1P48995 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TRPC1P48995 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRPC1P48995 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRPC1P48995 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRPC1P48995 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRPC1P48995 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRPC1P48995 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRPC1P48995 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.6 ms