Protein–RNA interactions for Protein: P36897

TGFBR1, TGF-beta receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR1P36897 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms