Protein–RNA interactions for Protein: P24522

GADD45A, Growth arrest and DNA damage-inducible protein GADD45 alpha, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GADD45AP24522 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GADD45AP24522 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GADD45AP24522 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GADD45AP24522 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GADD45AP24522 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GADD45AP24522 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GADD45AP24522 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GADD45AP24522 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GADD45AP24522 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GADD45AP24522 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GADD45AP24522 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GADD45AP24522 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GADD45AP24522 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GADD45AP24522 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GADD45AP24522 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GADD45AP24522 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GADD45AP24522 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GADD45AP24522 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GADD45AP24522 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GADD45AP24522 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GADD45AP24522 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GADD45AP24522 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GADD45AP24522 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GADD45AP24522 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GADD45AP24522 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GADD45AP24522 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GADD45AP24522 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GADD45AP24522 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GADD45AP24522 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GADD45AP24522 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GADD45AP24522 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GADD45AP24522 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GADD45AP24522 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GADD45AP24522 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GADD45AP24522 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GADD45AP24522 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GADD45AP24522 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GADD45AP24522 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GADD45AP24522 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GADD45AP24522 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GADD45AP24522 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GADD45AP24522 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GADD45AP24522 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GADD45AP24522 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GADD45AP24522 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GADD45AP24522 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GADD45AP24522 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GADD45AP24522 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GADD45AP24522 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GADD45AP24522 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GADD45AP24522 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GADD45AP24522 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GADD45AP24522 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GADD45AP24522 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GADD45AP24522 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GADD45AP24522 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GADD45AP24522 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GADD45AP24522 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GADD45AP24522 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GADD45AP24522 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GADD45AP24522 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GADD45AP24522 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GADD45AP24522 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GADD45AP24522 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GADD45AP24522 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GADD45AP24522 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GADD45AP24522 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GADD45AP24522 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GADD45AP24522 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GADD45AP24522 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GADD45AP24522 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GADD45AP24522 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GADD45AP24522 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GADD45AP24522 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GADD45AP24522 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GADD45AP24522 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GADD45AP24522 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GADD45AP24522 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GADD45AP24522 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GADD45AP24522 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GADD45AP24522 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GADD45AP24522 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GADD45AP24522 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GADD45AP24522 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GADD45AP24522 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GADD45AP24522 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GADD45AP24522 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GADD45AP24522 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GADD45AP24522 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GADD45AP24522 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GADD45AP24522 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GADD45AP24522 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GADD45AP24522 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GADD45AP24522 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GADD45AP24522 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GADD45AP24522 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GADD45AP24522 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GADD45AP24522 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GADD45AP24522 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GADD45AP24522 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms