Protein–RNA interactions for Protein: P17987

TCP1, T-complex protein 1 subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCP1P17987 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TCP1P17987 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TCP1P17987 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TCP1P17987 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TCP1P17987 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TCP1P17987 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TCP1P17987 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TCP1P17987 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TCP1P17987 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TCP1P17987 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TCP1P17987 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TCP1P17987 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TCP1P17987 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TCP1P17987 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TCP1P17987 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TCP1P17987 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TCP1P17987 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TCP1P17987 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TCP1P17987 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TCP1P17987 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TCP1P17987 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TCP1P17987 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TCP1P17987 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TCP1P17987 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TCP1P17987 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TCP1P17987 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TCP1P17987 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TCP1P17987 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TCP1P17987 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TCP1P17987 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TCP1P17987 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TCP1P17987 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TCP1P17987 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TCP1P17987 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TCP1P17987 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TCP1P17987 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TCP1P17987 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TCP1P17987 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TCP1P17987 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TCP1P17987 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TCP1P17987 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TCP1P17987 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TCP1P17987 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TCP1P17987 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TCP1P17987 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TCP1P17987 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TCP1P17987 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TCP1P17987 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TCP1P17987 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TCP1P17987 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TCP1P17987 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TCP1P17987 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TCP1P17987 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TCP1P17987 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TCP1P17987 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TCP1P17987 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TCP1P17987 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TCP1P17987 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TCP1P17987 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TCP1P17987 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TCP1P17987 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TCP1P17987 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TCP1P17987 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TCP1P17987 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TCP1P17987 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TCP1P17987 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TCP1P17987 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TCP1P17987 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TCP1P17987 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TCP1P17987 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TCP1P17987 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TCP1P17987 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TCP1P17987 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TCP1P17987 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TCP1P17987 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TCP1P17987 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TCP1P17987 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TCP1P17987 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TCP1P17987 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TCP1P17987 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TCP1P17987 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TCP1P17987 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TCP1P17987 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TCP1P17987 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TCP1P17987 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TCP1P17987 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TCP1P17987 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TCP1P17987 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TCP1P17987 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TCP1P17987 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TCP1P17987 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
TCP1P17987 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
TCP1P17987 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
TCP1P17987 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TCP1P17987 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TCP1P17987 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TCP1P17987 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TCP1P17987 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TCP1P17987 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TCP1P17987 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms