Protein–RNA interactions for Protein: P17482

HOXB9, Homeobox protein Hox-B9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB9P17482 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms