Protein–RNA interactions for Protein: O75323

NIPSNAP2, Protein NipSnap homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP2O75323 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NIPSNAP2O75323 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
NIPSNAP2O75323 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NIPSNAP2O75323 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NIPSNAP2O75323 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NIPSNAP2O75323 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NIPSNAP2O75323 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
NIPSNAP2O75323 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NIPSNAP2O75323 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NIPSNAP2O75323 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NIPSNAP2O75323 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NIPSNAP2O75323 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NIPSNAP2O75323 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NIPSNAP2O75323 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NIPSNAP2O75323 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NIPSNAP2O75323 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NIPSNAP2O75323 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NIPSNAP2O75323 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NIPSNAP2O75323 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NIPSNAP2O75323 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NIPSNAP2O75323 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NIPSNAP2O75323 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NIPSNAP2O75323 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NIPSNAP2O75323 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NIPSNAP2O75323 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NIPSNAP2O75323 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NIPSNAP2O75323 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NIPSNAP2O75323 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
NIPSNAP2O75323 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
NIPSNAP2O75323 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
NIPSNAP2O75323 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NIPSNAP2O75323 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NIPSNAP2O75323 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NIPSNAP2O75323 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NIPSNAP2O75323 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NIPSNAP2O75323 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NIPSNAP2O75323 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NIPSNAP2O75323 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NIPSNAP2O75323 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NIPSNAP2O75323 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NIPSNAP2O75323 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NIPSNAP2O75323 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NIPSNAP2O75323 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NIPSNAP2O75323 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NIPSNAP2O75323 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NIPSNAP2O75323 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NIPSNAP2O75323 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NIPSNAP2O75323 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NIPSNAP2O75323 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NIPSNAP2O75323 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NIPSNAP2O75323 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NIPSNAP2O75323 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NIPSNAP2O75323 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NIPSNAP2O75323 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NIPSNAP2O75323 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NIPSNAP2O75323 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NIPSNAP2O75323 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
NIPSNAP2O75323 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NIPSNAP2O75323 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NIPSNAP2O75323 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NIPSNAP2O75323 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NIPSNAP2O75323 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NIPSNAP2O75323 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NIPSNAP2O75323 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
NIPSNAP2O75323 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NIPSNAP2O75323 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NIPSNAP2O75323 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NIPSNAP2O75323 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NIPSNAP2O75323 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NIPSNAP2O75323 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NIPSNAP2O75323 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NIPSNAP2O75323 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NIPSNAP2O75323 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NIPSNAP2O75323 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NIPSNAP2O75323 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NIPSNAP2O75323 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NIPSNAP2O75323 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NIPSNAP2O75323 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NIPSNAP2O75323 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NIPSNAP2O75323 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NIPSNAP2O75323 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NIPSNAP2O75323 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NIPSNAP2O75323 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NIPSNAP2O75323 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NIPSNAP2O75323 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NIPSNAP2O75323 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NIPSNAP2O75323 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
NIPSNAP2O75323 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NIPSNAP2O75323 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NIPSNAP2O75323 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NIPSNAP2O75323 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NIPSNAP2O75323 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NIPSNAP2O75323 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NIPSNAP2O75323 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NIPSNAP2O75323 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NIPSNAP2O75323 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NIPSNAP2O75323 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NIPSNAP2O75323 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NIPSNAP2O75323 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NIPSNAP2O75323 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.9 ms