Protein–RNA interactions for Protein: E9PCH4

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PCH4 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
E9PCH4 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
E9PCH4 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
E9PCH4 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
E9PCH4 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
E9PCH4 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
E9PCH4 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
E9PCH4 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
E9PCH4 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
E9PCH4 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
E9PCH4 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
E9PCH4 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
E9PCH4 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
E9PCH4 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
E9PCH4 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
E9PCH4 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
E9PCH4 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
E9PCH4 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
E9PCH4 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
E9PCH4 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
E9PCH4 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
E9PCH4 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
E9PCH4 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
E9PCH4 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
E9PCH4 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
E9PCH4 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
E9PCH4 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
E9PCH4 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
E9PCH4 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
E9PCH4 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
E9PCH4 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
E9PCH4 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
E9PCH4 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
E9PCH4 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
E9PCH4 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
E9PCH4 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
E9PCH4 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
E9PCH4 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
E9PCH4 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
E9PCH4 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
E9PCH4 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
E9PCH4 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
E9PCH4 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
E9PCH4 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
E9PCH4 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
E9PCH4 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
E9PCH4 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
E9PCH4 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
E9PCH4 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
E9PCH4 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
E9PCH4 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
E9PCH4 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
E9PCH4 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
E9PCH4 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
E9PCH4 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
E9PCH4 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
E9PCH4 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
E9PCH4 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
E9PCH4 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
E9PCH4 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
E9PCH4 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
E9PCH4 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
E9PCH4 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
E9PCH4 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
E9PCH4 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
E9PCH4 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
E9PCH4 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
E9PCH4 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
E9PCH4 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
E9PCH4 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
E9PCH4 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
E9PCH4 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
E9PCH4 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
E9PCH4 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
E9PCH4 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
E9PCH4 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
E9PCH4 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
E9PCH4 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
E9PCH4 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
E9PCH4 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
E9PCH4 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
E9PCH4 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
E9PCH4 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
E9PCH4 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
E9PCH4 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
E9PCH4 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
E9PCH4 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
E9PCH4 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
E9PCH4 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
E9PCH4 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
E9PCH4 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
E9PCH4 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
E9PCH4 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
E9PCH4 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
E9PCH4 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
E9PCH4 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
E9PCH4 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
E9PCH4 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
E9PCH4 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
E9PCH4 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms