Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3F1

Putative TAP2-associated 6.5 kDa polypeptide, humanhuman

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Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9Y3F1 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Q9Y3F1 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Q9Y3F1 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Q9Y3F1 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Q9Y3F1 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Q9Y3F1 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Q9Y3F1 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Q9Y3F1 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Q9Y3F1 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Q9Y3F1 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Q9Y3F1 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Q9Y3F1 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Q9Y3F1 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Q9Y3F1 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Q9Y3F1 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Q9Y3F1 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Q9Y3F1 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Q9Y3F1 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Q9Y3F1 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Q9Y3F1 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Q9Y3F1 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Q9Y3F1 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Q9Y3F1 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Q9Y3F1 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Q9Y3F1 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Q9Y3F1 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Q9Y3F1 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Q9Y3F1 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Q9Y3F1 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Q9Y3F1 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Q9Y3F1 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Q9Y3F1 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Q9Y3F1 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Q9Y3F1 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Q9Y3F1 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Q9Y3F1 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Q9Y3F1 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Q9Y3F1 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Q9Y3F1 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Q9Y3F1 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Q9Y3F1 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Q9Y3F1 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q9Y3F1 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q9Y3F1 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q9Y3F1 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q9Y3F1 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q9Y3F1 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q9Y3F1 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q9Y3F1 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q9Y3F1 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q9Y3F1 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Q9Y3F1 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q9Y3F1 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Q9Y3F1 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q9Y3F1 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q9Y3F1 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q9Y3F1 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Q9Y3F1 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q9Y3F1 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q9Y3F1 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q9Y3F1 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q9Y3F1 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Q9Y3F1 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Q9Y3F1 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q9Y3F1 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q9Y3F1 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q9Y3F1 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q9Y3F1 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q9Y3F1 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Q9Y3F1 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q9Y3F1 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q9Y3F1 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q9Y3F1 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q9Y3F1 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q9Y3F1 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q9Y3F1 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q9Y3F1 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Q9Y3F1 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q9Y3F1 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q9Y3F1 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q9Y3F1 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q9Y3F1 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Q9Y3F1 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Q9Y3F1 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Q9Y3F1 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Q9Y3F1 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Q9Y3F1 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Q9Y3F1 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Q9Y3F1 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Q9Y3F1 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Q9Y3F1 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Q9Y3F1 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Q9Y3F1 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Q9Y3F1 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Q9Y3F1 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Q9Y3F1 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Q9Y3F1 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Q9Y3F1 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Q9Y3F1 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Q9Y3F1 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
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