Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVC6

MED17, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 17, humanhuman

Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED17Q9NVC6 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MED17Q9NVC6 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MED17Q9NVC6 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MED17Q9NVC6 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MED17Q9NVC6 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MED17Q9NVC6 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MED17Q9NVC6 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MED17Q9NVC6 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MED17Q9NVC6 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MED17Q9NVC6 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MED17Q9NVC6 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MED17Q9NVC6 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MED17Q9NVC6 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MED17Q9NVC6 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MED17Q9NVC6 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MED17Q9NVC6 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MED17Q9NVC6 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MED17Q9NVC6 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MED17Q9NVC6 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MED17Q9NVC6 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MED17Q9NVC6 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
MED17Q9NVC6 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MED17Q9NVC6 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MED17Q9NVC6 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MED17Q9NVC6 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MED17Q9NVC6 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MED17Q9NVC6 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MED17Q9NVC6 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MED17Q9NVC6 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MED17Q9NVC6 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MED17Q9NVC6 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MED17Q9NVC6 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
MED17Q9NVC6 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
MED17Q9NVC6 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MED17Q9NVC6 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MED17Q9NVC6 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MED17Q9NVC6 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MED17Q9NVC6 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MED17Q9NVC6 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MED17Q9NVC6 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MED17Q9NVC6 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MED17Q9NVC6 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MED17Q9NVC6 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
MED17Q9NVC6 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
MED17Q9NVC6 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
MED17Q9NVC6 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
MED17Q9NVC6 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MED17Q9NVC6 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MED17Q9NVC6 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MED17Q9NVC6 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MED17Q9NVC6 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MED17Q9NVC6 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MED17Q9NVC6 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MED17Q9NVC6 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MED17Q9NVC6 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MED17Q9NVC6 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MED17Q9NVC6 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MED17Q9NVC6 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MED17Q9NVC6 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MED17Q9NVC6 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MED17Q9NVC6 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MED17Q9NVC6 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MED17Q9NVC6 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MED17Q9NVC6 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MED17Q9NVC6 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
MED17Q9NVC6 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MED17Q9NVC6 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MED17Q9NVC6 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MED17Q9NVC6 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MED17Q9NVC6 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MED17Q9NVC6 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
MED17Q9NVC6 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MED17Q9NVC6 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MED17Q9NVC6 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MED17Q9NVC6 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
MED17Q9NVC6 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MED17Q9NVC6 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MED17Q9NVC6 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MED17Q9NVC6 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MED17Q9NVC6 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MED17Q9NVC6 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MED17Q9NVC6 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MED17Q9NVC6 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MED17Q9NVC6 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
MED17Q9NVC6 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MED17Q9NVC6 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MED17Q9NVC6 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MED17Q9NVC6 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MED17Q9NVC6 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MED17Q9NVC6 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MED17Q9NVC6 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MED17Q9NVC6 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MED17Q9NVC6 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MED17Q9NVC6 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MED17Q9NVC6 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MED17Q9NVC6 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MED17Q9NVC6 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MED17Q9NVC6 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MED17Q9NVC6 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MED17Q9NVC6 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.5 ms