Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYJ9

YTHDF1, YTH domain-containing family protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDF1Q9BYJ9 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
YTHDF1Q9BYJ9 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
YTHDF1Q9BYJ9 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
YTHDF1Q9BYJ9 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
YTHDF1Q9BYJ9 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
YTHDF1Q9BYJ9 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
YTHDF1Q9BYJ9 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
YTHDF1Q9BYJ9 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
YTHDF1Q9BYJ9 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
YTHDF1Q9BYJ9 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
YTHDF1Q9BYJ9 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
YTHDF1Q9BYJ9 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
YTHDF1Q9BYJ9 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
YTHDF1Q9BYJ9 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
YTHDF1Q9BYJ9 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
YTHDF1Q9BYJ9 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
YTHDF1Q9BYJ9 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
YTHDF1Q9BYJ9 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
YTHDF1Q9BYJ9 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
YTHDF1Q9BYJ9 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
YTHDF1Q9BYJ9 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
YTHDF1Q9BYJ9 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
YTHDF1Q9BYJ9 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
YTHDF1Q9BYJ9 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
YTHDF1Q9BYJ9 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
YTHDF1Q9BYJ9 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
YTHDF1Q9BYJ9 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
YTHDF1Q9BYJ9 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
YTHDF1Q9BYJ9 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
YTHDF1Q9BYJ9 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
YTHDF1Q9BYJ9 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
YTHDF1Q9BYJ9 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
YTHDF1Q9BYJ9 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
YTHDF1Q9BYJ9 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
YTHDF1Q9BYJ9 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
YTHDF1Q9BYJ9 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
YTHDF1Q9BYJ9 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
YTHDF1Q9BYJ9 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
YTHDF1Q9BYJ9 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
YTHDF1Q9BYJ9 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
YTHDF1Q9BYJ9 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
YTHDF1Q9BYJ9 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
YTHDF1Q9BYJ9 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
YTHDF1Q9BYJ9 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
YTHDF1Q9BYJ9 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
YTHDF1Q9BYJ9 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
YTHDF1Q9BYJ9 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
YTHDF1Q9BYJ9 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
YTHDF1Q9BYJ9 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
YTHDF1Q9BYJ9 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
YTHDF1Q9BYJ9 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
YTHDF1Q9BYJ9 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
YTHDF1Q9BYJ9 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
YTHDF1Q9BYJ9 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
YTHDF1Q9BYJ9 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
YTHDF1Q9BYJ9 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
YTHDF1Q9BYJ9 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
YTHDF1Q9BYJ9 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
YTHDF1Q9BYJ9 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
YTHDF1Q9BYJ9 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
YTHDF1Q9BYJ9 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
YTHDF1Q9BYJ9 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
YTHDF1Q9BYJ9 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
YTHDF1Q9BYJ9 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
YTHDF1Q9BYJ9 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
YTHDF1Q9BYJ9 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
YTHDF1Q9BYJ9 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
YTHDF1Q9BYJ9 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
YTHDF1Q9BYJ9 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
YTHDF1Q9BYJ9 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
YTHDF1Q9BYJ9 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
YTHDF1Q9BYJ9 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
YTHDF1Q9BYJ9 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
YTHDF1Q9BYJ9 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
YTHDF1Q9BYJ9 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
YTHDF1Q9BYJ9 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
YTHDF1Q9BYJ9 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
YTHDF1Q9BYJ9 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
YTHDF1Q9BYJ9 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
YTHDF1Q9BYJ9 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
YTHDF1Q9BYJ9 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
YTHDF1Q9BYJ9 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
YTHDF1Q9BYJ9 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
YTHDF1Q9BYJ9 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
YTHDF1Q9BYJ9 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
YTHDF1Q9BYJ9 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
YTHDF1Q9BYJ9 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
YTHDF1Q9BYJ9 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
YTHDF1Q9BYJ9 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
YTHDF1Q9BYJ9 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
YTHDF1Q9BYJ9 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
YTHDF1Q9BYJ9 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
YTHDF1Q9BYJ9 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
YTHDF1Q9BYJ9 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
YTHDF1Q9BYJ9 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
YTHDF1Q9BYJ9 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
YTHDF1Q9BYJ9 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
YTHDF1Q9BYJ9 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
YTHDF1Q9BYJ9 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
YTHDF1Q9BYJ9 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms