Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWF3

RBM4, RNA-binding protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM4Q9BWF3 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RBM4Q9BWF3 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RBM4Q9BWF3 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RBM4Q9BWF3 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RBM4Q9BWF3 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RBM4Q9BWF3 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RBM4Q9BWF3 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RBM4Q9BWF3 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RBM4Q9BWF3 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RBM4Q9BWF3 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RBM4Q9BWF3 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RBM4Q9BWF3 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RBM4Q9BWF3 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RBM4Q9BWF3 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RBM4Q9BWF3 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
RBM4Q9BWF3 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
RBM4Q9BWF3 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
RBM4Q9BWF3 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
RBM4Q9BWF3 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RBM4Q9BWF3 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RBM4Q9BWF3 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RBM4Q9BWF3 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RBM4Q9BWF3 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RBM4Q9BWF3 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RBM4Q9BWF3 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RBM4Q9BWF3 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RBM4Q9BWF3 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RBM4Q9BWF3 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RBM4Q9BWF3 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RBM4Q9BWF3 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RBM4Q9BWF3 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RBM4Q9BWF3 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RBM4Q9BWF3 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RBM4Q9BWF3 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RBM4Q9BWF3 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RBM4Q9BWF3 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RBM4Q9BWF3 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RBM4Q9BWF3 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RBM4Q9BWF3 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RBM4Q9BWF3 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RBM4Q9BWF3 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RBM4Q9BWF3 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RBM4Q9BWF3 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RBM4Q9BWF3 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RBM4Q9BWF3 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RBM4Q9BWF3 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RBM4Q9BWF3 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RBM4Q9BWF3 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RBM4Q9BWF3 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RBM4Q9BWF3 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RBM4Q9BWF3 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RBM4Q9BWF3 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RBM4Q9BWF3 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBM4Q9BWF3 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBM4Q9BWF3 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBM4Q9BWF3 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBM4Q9BWF3 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RBM4Q9BWF3 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBM4Q9BWF3 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBM4Q9BWF3 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBM4Q9BWF3 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBM4Q9BWF3 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBM4Q9BWF3 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBM4Q9BWF3 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBM4Q9BWF3 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBM4Q9BWF3 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBM4Q9BWF3 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBM4Q9BWF3 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBM4Q9BWF3 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBM4Q9BWF3 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBM4Q9BWF3 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RBM4Q9BWF3 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBM4Q9BWF3 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBM4Q9BWF3 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBM4Q9BWF3 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBM4Q9BWF3 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBM4Q9BWF3 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBM4Q9BWF3 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBM4Q9BWF3 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBM4Q9BWF3 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBM4Q9BWF3 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBM4Q9BWF3 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBM4Q9BWF3 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBM4Q9BWF3 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBM4Q9BWF3 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBM4Q9BWF3 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBM4Q9BWF3 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBM4Q9BWF3 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBM4Q9BWF3 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBM4Q9BWF3 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBM4Q9BWF3 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBM4Q9BWF3 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBM4Q9BWF3 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBM4Q9BWF3 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBM4Q9BWF3 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBM4Q9BWF3 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBM4Q9BWF3 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBM4Q9BWF3 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBM4Q9BWF3 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBM4Q9BWF3 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms