Protein–RNA interactions for Protein: Q92837

FRAT1, Proto-oncogene FRAT1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRAT1Q92837 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FRAT1Q92837 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FRAT1Q92837 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FRAT1Q92837 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FRAT1Q92837 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FRAT1Q92837 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FRAT1Q92837 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FRAT1Q92837 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FRAT1Q92837 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FRAT1Q92837 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
FRAT1Q92837 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FRAT1Q92837 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FRAT1Q92837 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FRAT1Q92837 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
FRAT1Q92837 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FRAT1Q92837 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FRAT1Q92837 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FRAT1Q92837 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FRAT1Q92837 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FRAT1Q92837 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FRAT1Q92837 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FRAT1Q92837 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FRAT1Q92837 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FRAT1Q92837 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FRAT1Q92837 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FRAT1Q92837 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FRAT1Q92837 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FRAT1Q92837 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FRAT1Q92837 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FRAT1Q92837 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FRAT1Q92837 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FRAT1Q92837 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FRAT1Q92837 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FRAT1Q92837 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FRAT1Q92837 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
FRAT1Q92837 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FRAT1Q92837 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FRAT1Q92837 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FRAT1Q92837 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FRAT1Q92837 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FRAT1Q92837 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FRAT1Q92837 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FRAT1Q92837 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FRAT1Q92837 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FRAT1Q92837 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FRAT1Q92837 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FRAT1Q92837 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FRAT1Q92837 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
FRAT1Q92837 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
FRAT1Q92837 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FRAT1Q92837 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FRAT1Q92837 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FRAT1Q92837 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
FRAT1Q92837 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FRAT1Q92837 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FRAT1Q92837 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FRAT1Q92837 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FRAT1Q92837 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FRAT1Q92837 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
FRAT1Q92837 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
FRAT1Q92837 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FRAT1Q92837 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FRAT1Q92837 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FRAT1Q92837 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FRAT1Q92837 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FRAT1Q92837 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FRAT1Q92837 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FRAT1Q92837 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FRAT1Q92837 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FRAT1Q92837 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FRAT1Q92837 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FRAT1Q92837 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FRAT1Q92837 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FRAT1Q92837 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FRAT1Q92837 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FRAT1Q92837 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FRAT1Q92837 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FRAT1Q92837 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FRAT1Q92837 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FRAT1Q92837 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
FRAT1Q92837 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FRAT1Q92837 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FRAT1Q92837 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
FRAT1Q92837 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FRAT1Q92837 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FRAT1Q92837 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FRAT1Q92837 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FRAT1Q92837 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FRAT1Q92837 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FRAT1Q92837 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FRAT1Q92837 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FRAT1Q92837 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FRAT1Q92837 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FRAT1Q92837 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FRAT1Q92837 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FRAT1Q92837 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FRAT1Q92837 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FRAT1Q92837 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FRAT1Q92837 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FRAT1Q92837 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms