Protein–RNA interactions for Protein: Q92826

HOXB13, Homeobox protein Hox-B13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB13Q92826 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HOXB13Q92826 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HOXB13Q92826 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HOXB13Q92826 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HOXB13Q92826 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HOXB13Q92826 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HOXB13Q92826 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HOXB13Q92826 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HOXB13Q92826 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HOXB13Q92826 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
HOXB13Q92826 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HOXB13Q92826 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HOXB13Q92826 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXB13Q92826 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXB13Q92826 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXB13Q92826 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXB13Q92826 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXB13Q92826 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXB13Q92826 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXB13Q92826 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXB13Q92826 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXB13Q92826 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXB13Q92826 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXB13Q92826 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms