Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ74

CTTNBP2, Cortactin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNBP2Q8WZ74 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CTTNBP2Q8WZ74 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CTTNBP2Q8WZ74 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CTTNBP2Q8WZ74 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CTTNBP2Q8WZ74 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CTTNBP2Q8WZ74 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CTTNBP2Q8WZ74 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CTTNBP2Q8WZ74 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CTTNBP2Q8WZ74 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CTTNBP2Q8WZ74 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
CTTNBP2Q8WZ74 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
CTTNBP2Q8WZ74 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CTTNBP2Q8WZ74 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CTTNBP2Q8WZ74 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CTTNBP2Q8WZ74 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CTTNBP2Q8WZ74 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CTTNBP2Q8WZ74 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CTTNBP2Q8WZ74 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
CTTNBP2Q8WZ74 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
CTTNBP2Q8WZ74 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CTTNBP2Q8WZ74 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CTTNBP2Q8WZ74 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CTTNBP2Q8WZ74 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CTTNBP2Q8WZ74 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
CTTNBP2Q8WZ74 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CTTNBP2Q8WZ74 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
CTTNBP2Q8WZ74 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CTTNBP2Q8WZ74 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CTTNBP2Q8WZ74 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CTTNBP2Q8WZ74 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CTTNBP2Q8WZ74 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
CTTNBP2Q8WZ74 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CTTNBP2Q8WZ74 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CTTNBP2Q8WZ74 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CTTNBP2Q8WZ74 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CTTNBP2Q8WZ74 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
CTTNBP2Q8WZ74 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CTTNBP2Q8WZ74 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CTTNBP2Q8WZ74 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CTTNBP2Q8WZ74 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CTTNBP2Q8WZ74 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CTTNBP2Q8WZ74 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CTTNBP2Q8WZ74 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CTTNBP2Q8WZ74 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CTTNBP2Q8WZ74 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CTTNBP2Q8WZ74 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CTTNBP2Q8WZ74 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CTTNBP2Q8WZ74 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CTTNBP2Q8WZ74 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CTTNBP2Q8WZ74 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CTTNBP2Q8WZ74 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CTTNBP2Q8WZ74 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CTTNBP2Q8WZ74 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CTTNBP2Q8WZ74 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CTTNBP2Q8WZ74 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CTTNBP2Q8WZ74 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CTTNBP2Q8WZ74 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CTTNBP2Q8WZ74 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CTTNBP2Q8WZ74 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CTTNBP2Q8WZ74 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CTTNBP2Q8WZ74 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CTTNBP2Q8WZ74 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CTTNBP2Q8WZ74 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CTTNBP2Q8WZ74 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CTTNBP2Q8WZ74 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CTTNBP2Q8WZ74 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CTTNBP2Q8WZ74 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CTTNBP2Q8WZ74 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CTTNBP2Q8WZ74 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
CTTNBP2Q8WZ74 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CTTNBP2Q8WZ74 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CTTNBP2Q8WZ74 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CTTNBP2Q8WZ74 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CTTNBP2Q8WZ74 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
CTTNBP2Q8WZ74 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CTTNBP2Q8WZ74 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CTTNBP2Q8WZ74 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CTTNBP2Q8WZ74 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CTTNBP2Q8WZ74 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CTTNBP2Q8WZ74 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CTTNBP2Q8WZ74 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CTTNBP2Q8WZ74 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CTTNBP2Q8WZ74 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CTTNBP2Q8WZ74 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CTTNBP2Q8WZ74 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CTTNBP2Q8WZ74 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CTTNBP2Q8WZ74 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
CTTNBP2Q8WZ74 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
CTTNBP2Q8WZ74 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
CTTNBP2Q8WZ74 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CTTNBP2Q8WZ74 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CTTNBP2Q8WZ74 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CTTNBP2Q8WZ74 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CTTNBP2Q8WZ74 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CTTNBP2Q8WZ74 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CTTNBP2Q8WZ74 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CTTNBP2Q8WZ74 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CTTNBP2Q8WZ74 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CTTNBP2Q8WZ74 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CTTNBP2Q8WZ74 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms