Protein–RNA interactions for Protein: Q71RS6

SLC24A5, Sodium/potassium/calcium exchanger 5, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC24A5Q71RS6 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC24A5Q71RS6 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC24A5Q71RS6 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC24A5Q71RS6 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC24A5Q71RS6 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC24A5Q71RS6 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC24A5Q71RS6 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC24A5Q71RS6 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC24A5Q71RS6 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC24A5Q71RS6 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC24A5Q71RS6 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC24A5Q71RS6 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC24A5Q71RS6 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC24A5Q71RS6 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC24A5Q71RS6 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC24A5Q71RS6 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC24A5Q71RS6 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC24A5Q71RS6 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC24A5Q71RS6 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC24A5Q71RS6 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC24A5Q71RS6 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC24A5Q71RS6 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC24A5Q71RS6 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC24A5Q71RS6 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC24A5Q71RS6 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC24A5Q71RS6 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC24A5Q71RS6 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC24A5Q71RS6 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC24A5Q71RS6 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC24A5Q71RS6 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC24A5Q71RS6 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC24A5Q71RS6 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC24A5Q71RS6 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC24A5Q71RS6 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC24A5Q71RS6 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC24A5Q71RS6 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC24A5Q71RS6 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC24A5Q71RS6 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC24A5Q71RS6 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC24A5Q71RS6 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC24A5Q71RS6 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC24A5Q71RS6 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC24A5Q71RS6 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC24A5Q71RS6 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC24A5Q71RS6 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC24A5Q71RS6 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC24A5Q71RS6 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC24A5Q71RS6 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC24A5Q71RS6 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC24A5Q71RS6 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC24A5Q71RS6 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC24A5Q71RS6 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC24A5Q71RS6 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC24A5Q71RS6 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC24A5Q71RS6 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC24A5Q71RS6 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC24A5Q71RS6 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC24A5Q71RS6 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC24A5Q71RS6 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC24A5Q71RS6 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC24A5Q71RS6 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC24A5Q71RS6 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC24A5Q71RS6 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC24A5Q71RS6 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC24A5Q71RS6 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC24A5Q71RS6 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC24A5Q71RS6 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC24A5Q71RS6 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC24A5Q71RS6 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC24A5Q71RS6 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC24A5Q71RS6 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC24A5Q71RS6 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC24A5Q71RS6 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC24A5Q71RS6 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC24A5Q71RS6 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC24A5Q71RS6 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC24A5Q71RS6 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC24A5Q71RS6 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC24A5Q71RS6 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC24A5Q71RS6 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC24A5Q71RS6 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC24A5Q71RS6 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC24A5Q71RS6 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC24A5Q71RS6 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC24A5Q71RS6 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC24A5Q71RS6 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC24A5Q71RS6 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC24A5Q71RS6 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC24A5Q71RS6 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC24A5Q71RS6 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC24A5Q71RS6 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC24A5Q71RS6 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC24A5Q71RS6 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC24A5Q71RS6 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC24A5Q71RS6 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC24A5Q71RS6 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC24A5Q71RS6 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC24A5Q71RS6 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC24A5Q71RS6 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC24A5Q71RS6 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.2 ms