Protein–RNA interactions for Protein: Q14457

BECN1, Beclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BECN1Q14457 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
BECN1Q14457 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
BECN1Q14457 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
BECN1Q14457 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
BECN1Q14457 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
BECN1Q14457 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
BECN1Q14457 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
BECN1Q14457 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
BECN1Q14457 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
BECN1Q14457 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
BECN1Q14457 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
BECN1Q14457 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
BECN1Q14457 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
BECN1Q14457 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
BECN1Q14457 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
BECN1Q14457 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
BECN1Q14457 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
BECN1Q14457 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
BECN1Q14457 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
BECN1Q14457 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
BECN1Q14457 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
BECN1Q14457 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
BECN1Q14457 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
BECN1Q14457 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
BECN1Q14457 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
BECN1Q14457 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
BECN1Q14457 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
BECN1Q14457 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
BECN1Q14457 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
BECN1Q14457 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
BECN1Q14457 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
BECN1Q14457 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
BECN1Q14457 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
BECN1Q14457 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
BECN1Q14457 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
BECN1Q14457 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
BECN1Q14457 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
BECN1Q14457 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
BECN1Q14457 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
BECN1Q14457 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
BECN1Q14457 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
BECN1Q14457 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
BECN1Q14457 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
BECN1Q14457 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
BECN1Q14457 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
BECN1Q14457 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
BECN1Q14457 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
BECN1Q14457 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
BECN1Q14457 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
BECN1Q14457 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
BECN1Q14457 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
BECN1Q14457 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
BECN1Q14457 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
BECN1Q14457 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
BECN1Q14457 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
BECN1Q14457 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
BECN1Q14457 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
BECN1Q14457 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
BECN1Q14457 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
BECN1Q14457 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
BECN1Q14457 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
BECN1Q14457 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
BECN1Q14457 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
BECN1Q14457 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
BECN1Q14457 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
BECN1Q14457 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
BECN1Q14457 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
BECN1Q14457 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
BECN1Q14457 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
BECN1Q14457 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
BECN1Q14457 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
BECN1Q14457 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
BECN1Q14457 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
BECN1Q14457 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
BECN1Q14457 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
BECN1Q14457 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
BECN1Q14457 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
BECN1Q14457 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
BECN1Q14457 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
BECN1Q14457 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
BECN1Q14457 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
BECN1Q14457 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
BECN1Q14457 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
BECN1Q14457 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
BECN1Q14457 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
BECN1Q14457 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
BECN1Q14457 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
BECN1Q14457 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
BECN1Q14457 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
BECN1Q14457 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
BECN1Q14457 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
BECN1Q14457 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
BECN1Q14457 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
BECN1Q14457 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
BECN1Q14457 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
BECN1Q14457 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
BECN1Q14457 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
BECN1Q14457 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
BECN1Q14457 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
BECN1Q14457 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
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