Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

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Length 2,109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF3C1Q12789 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF3C1Q12789 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF3C1Q12789 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF3C1Q12789 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF3C1Q12789 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF3C1Q12789 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF3C1Q12789 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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GTF3C1Q12789 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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GTF3C1Q12789 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF3C1Q12789 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF3C1Q12789 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF3C1Q12789 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF3C1Q12789 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF3C1Q12789 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF3C1Q12789 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF3C1Q12789 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF3C1Q12789 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF3C1Q12789 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF3C1Q12789 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF3C1Q12789 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF3C1Q12789 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF3C1Q12789 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF3C1Q12789 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF3C1Q12789 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF3C1Q12789 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF3C1Q12789 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF3C1Q12789 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF3C1Q12789 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF3C1Q12789 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF3C1Q12789 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF3C1Q12789 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF3C1Q12789 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF3C1Q12789 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF3C1Q12789 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF3C1Q12789 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF3C1Q12789 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF3C1Q12789 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF3C1Q12789 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF3C1Q12789 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF3C1Q12789 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF3C1Q12789 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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GTF3C1Q12789 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF3C1Q12789 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF3C1Q12789 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF3C1Q12789 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF3C1Q12789 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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GTF3C1Q12789 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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GTF3C1Q12789 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF3C1Q12789 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF3C1Q12789 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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GTF3C1Q12789 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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GTF3C1Q12789 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF3C1Q12789 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF3C1Q12789 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF3C1Q12789 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF3C1Q12789 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF3C1Q12789 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF3C1Q12789 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF3C1Q12789 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF3C1Q12789 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF3C1Q12789 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF3C1Q12789 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF3C1Q12789 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF3C1Q12789 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF3C1Q12789 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF3C1Q12789 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF3C1Q12789 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF3C1Q12789 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF3C1Q12789 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF3C1Q12789 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF3C1Q12789 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF3C1Q12789 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF3C1Q12789 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF3C1Q12789 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF3C1Q12789 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF3C1Q12789 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF3C1Q12789 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
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