Protein–RNA interactions for Protein: Q06609

RAD51, DNA repair protein RAD51 homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51Q06609 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAD51Q06609 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAD51Q06609 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAD51Q06609 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAD51Q06609 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAD51Q06609 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAD51Q06609 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAD51Q06609 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAD51Q06609 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAD51Q06609 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAD51Q06609 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAD51Q06609 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAD51Q06609 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
RAD51Q06609 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAD51Q06609 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAD51Q06609 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAD51Q06609 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAD51Q06609 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAD51Q06609 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAD51Q06609 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAD51Q06609 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAD51Q06609 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAD51Q06609 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAD51Q06609 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAD51Q06609 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAD51Q06609 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
RAD51Q06609 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
RAD51Q06609 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAD51Q06609 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
RAD51Q06609 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAD51Q06609 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAD51Q06609 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAD51Q06609 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAD51Q06609 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAD51Q06609 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAD51Q06609 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAD51Q06609 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAD51Q06609 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAD51Q06609 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAD51Q06609 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAD51Q06609 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
RAD51Q06609 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAD51Q06609 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAD51Q06609 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAD51Q06609 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAD51Q06609 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAD51Q06609 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAD51Q06609 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAD51Q06609 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAD51Q06609 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAD51Q06609 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAD51Q06609 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAD51Q06609 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAD51Q06609 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAD51Q06609 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAD51Q06609 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAD51Q06609 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAD51Q06609 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAD51Q06609 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAD51Q06609 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAD51Q06609 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAD51Q06609 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAD51Q06609 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAD51Q06609 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAD51Q06609 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAD51Q06609 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAD51Q06609 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAD51Q06609 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAD51Q06609 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAD51Q06609 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAD51Q06609 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAD51Q06609 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAD51Q06609 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAD51Q06609 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAD51Q06609 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAD51Q06609 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAD51Q06609 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAD51Q06609 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAD51Q06609 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAD51Q06609 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAD51Q06609 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAD51Q06609 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAD51Q06609 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAD51Q06609 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAD51Q06609 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAD51Q06609 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAD51Q06609 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAD51Q06609 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
RAD51Q06609 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAD51Q06609 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAD51Q06609 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAD51Q06609 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAD51Q06609 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAD51Q06609 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAD51Q06609 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAD51Q06609 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAD51Q06609 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAD51Q06609 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAD51Q06609 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAD51Q06609 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms