Protein–RNA interactions for Protein: Q00535

CDK5, Cyclin-dependent-like kinase 5, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5Q00535 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK5Q00535 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK5Q00535 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK5Q00535 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK5Q00535 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK5Q00535 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK5Q00535 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK5Q00535 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK5Q00535 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK5Q00535 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK5Q00535 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK5Q00535 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK5Q00535 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK5Q00535 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK5Q00535 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK5Q00535 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK5Q00535 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK5Q00535 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK5Q00535 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK5Q00535 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK5Q00535 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK5Q00535 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK5Q00535 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK5Q00535 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK5Q00535 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK5Q00535 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK5Q00535 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK5Q00535 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK5Q00535 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK5Q00535 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK5Q00535 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK5Q00535 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK5Q00535 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK5Q00535 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK5Q00535 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK5Q00535 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK5Q00535 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK5Q00535 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK5Q00535 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK5Q00535 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK5Q00535 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK5Q00535 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK5Q00535 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK5Q00535 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK5Q00535 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK5Q00535 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK5Q00535 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK5Q00535 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK5Q00535 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK5Q00535 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK5Q00535 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK5Q00535 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK5Q00535 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK5Q00535 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK5Q00535 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK5Q00535 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK5Q00535 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK5Q00535 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK5Q00535 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK5Q00535 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK5Q00535 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK5Q00535 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK5Q00535 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK5Q00535 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK5Q00535 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK5Q00535 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK5Q00535 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK5Q00535 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK5Q00535 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK5Q00535 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK5Q00535 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK5Q00535 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK5Q00535 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK5Q00535 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK5Q00535 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK5Q00535 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK5Q00535 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK5Q00535 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK5Q00535 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK5Q00535 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK5Q00535 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK5Q00535 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK5Q00535 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK5Q00535 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK5Q00535 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK5Q00535 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK5Q00535 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK5Q00535 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK5Q00535 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK5Q00535 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK5Q00535 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK5Q00535 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK5Q00535 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK5Q00535 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK5Q00535 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK5Q00535 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK5Q00535 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK5Q00535 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK5Q00535 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK5Q00535 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms