Protein–RNA interactions for Protein: P59037

LINC00313, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00313, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00313P59037 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC9.93□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC9.93□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC9.93□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms