Protein–RNA interactions for Protein: P36383

GJC1, Gap junction gamma-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJC1P36383 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GJC1P36383 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GJC1P36383 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GJC1P36383 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GJC1P36383 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GJC1P36383 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GJC1P36383 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GJC1P36383 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GJC1P36383 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GJC1P36383 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GJC1P36383 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GJC1P36383 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
GJC1P36383 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GJC1P36383 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GJC1P36383 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GJC1P36383 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GJC1P36383 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GJC1P36383 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GJC1P36383 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GJC1P36383 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GJC1P36383 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GJC1P36383 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
GJC1P36383 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GJC1P36383 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GJC1P36383 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GJC1P36383 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
GJC1P36383 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GJC1P36383 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GJC1P36383 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
GJC1P36383 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GJC1P36383 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GJC1P36383 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GJC1P36383 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GJC1P36383 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
GJC1P36383 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GJC1P36383 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GJC1P36383 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GJC1P36383 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GJC1P36383 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GJC1P36383 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GJC1P36383 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GJC1P36383 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GJC1P36383 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GJC1P36383 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GJC1P36383 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GJC1P36383 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GJC1P36383 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GJC1P36383 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GJC1P36383 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GJC1P36383 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GJC1P36383 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GJC1P36383 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GJC1P36383 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GJC1P36383 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GJC1P36383 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GJC1P36383 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GJC1P36383 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GJC1P36383 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GJC1P36383 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GJC1P36383 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
GJC1P36383 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GJC1P36383 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GJC1P36383 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GJC1P36383 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GJC1P36383 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GJC1P36383 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GJC1P36383 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GJC1P36383 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GJC1P36383 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GJC1P36383 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GJC1P36383 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GJC1P36383 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
GJC1P36383 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GJC1P36383 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GJC1P36383 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
GJC1P36383 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GJC1P36383 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GJC1P36383 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GJC1P36383 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GJC1P36383 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GJC1P36383 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GJC1P36383 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GJC1P36383 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GJC1P36383 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GJC1P36383 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GJC1P36383 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GJC1P36383 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GJC1P36383 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GJC1P36383 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GJC1P36383 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GJC1P36383 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GJC1P36383 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GJC1P36383 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GJC1P36383 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GJC1P36383 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GJC1P36383 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
GJC1P36383 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GJC1P36383 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GJC1P36383 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GJC1P36383 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms