Protein–RNA interactions for Protein: P35269

GTF2F1, General transcription factor IIF subunit 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2F1P35269 PPFIA4-202ENST00000295706 6395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.142e-6■■■□□ 14.6
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GTF2F1P35269 MZT2B-205ENST00000457492 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 515.66■□□□□ 0.12e-6■■■□□ 14.6
GTF2F1P35269 RNF214-201ENST00000300650 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.12e-6■■■□□ 14.6
GTF2F1P35269 CSNK1G2-210ENST00000614707 249 ntTSL 215.64■□□□□ 0.092e-6■■■□□ 14.6
GTF2F1P35269 PPFIA4-204ENST00000447715 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.092e-6■■■□□ 14.6
GTF2F1P35269 TEX264-206ENST00000419358 531 ntAPPRIS ALT2 TSL 215.63■□□□□ 0.092e-6■■■□□ 14.6
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GTF2F1P35269 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.052e-6■■■□□ 14.6
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GTF2F1P35269 SIRT2-212ENST00000451193 556 ntTSL 415.13■□□□□ 0.012e-6■■■□□ 14.6
GTF2F1P35269 PPP1R10-201ENST00000376511 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.012e-6■■■□□ 14.6
GTF2F1P35269 PPFIA4-211ENST00000600426 2967 ntAPPRIS ALT2 TSL 214.99□□□□□ -0.012e-6■■■□□ 14.6
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GTF2F1P35269 CNBP-207ENST00000502976 1626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.032e-6■■■□□ 14.6
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GTF2F1P35269 CNBP-203ENST00000446936 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.052e-6■■■□□ 14.6
GTF2F1P35269 CNBP-204ENST00000451728 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.052e-6■■■□□ 14.6
GTF2F1P35269 SIRT2-208ENST00000423526 556 ntTSL 414.7□□□□□ -0.062e-6■■■□□ 14.6
GTF2F1P35269 SIRT2-209ENST00000437828 555 ntTSL 414.7□□□□□ -0.062e-6■■■□□ 14.6
GTF2F1P35269 RNF214-205ENST00000531287 1706 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.072e-6■■■□□ 14.6
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GTF2F1P35269 CNBP-202ENST00000441626 1040 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.192e-6■■■□□ 14.6
GTF2F1P35269 SIRT2-205ENST00000407552 890 ntTSL 213.8□□□□□ -0.22e-6■■■□□ 14.6
GTF2F1P35269 SIRT2-217ENST00000491960 619 ntTSL 413.8□□□□□ -0.22e-6■■■□□ 14.6
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GTF2F1P35269 CLN6-217ENST00000636964 3335 ntTSL 213.46□□□□□ -0.252e-6■■■□□ 14.6
GTF2F1P35269 SIRT2-206ENST00000414941 1251 ntTSL 513.44□□□□□ -0.262e-6■■■□□ 14.6
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GTF2F1P35269 CCDC137-203ENST00000572531 265 ntTSL 312.94□□□□□ -0.342e-6■■■□□ 14.6
GTF2F1P35269 SIRT2-211ENST00000447739 578 ntTSL 412.92□□□□□ -0.342e-6■■■□□ 14.6
GTF2F1P35269 SGPL1-202ENST00000373202 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.366e-14■■■□□ 14.6
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GTF2F1P35269 ALDH1A2-207ENST00000558231 1664 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.472e-6■■■□□ 14.6
GTF2F1P35269 CNBP-206ENST00000502372 1026 ntTSL 512.06□□□□□ -0.482e-6■■■□□ 14.6
GTF2F1P35269 ALDH1A2-202ENST00000347587 3297 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.512e-6■■■□□ 14.6
GTF2F1P35269 UBE2D3-203ENST00000343106 2389 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.562e-6■■■□□ 14.6
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GTF2F1P35269 AC099811.2-202ENST00000592248 694 ntTSL 311.09□□□□□ -0.632e-6■■■□□ 14.6
GTF2F1P35269 LARS-202ENST00000394434 4766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.642e-6■■■□□ 14.6
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GTF2F1P35269 ALDH1A2-212ENST00000558595 484 ntTSL 310.86□□□□□ -0.672e-6■■■□□ 14.6
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GTF2F1P35269 C6orf106-201ENST00000374021 916 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.72e-6■■■□□ 14.6
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GTF2F1P35269 AC099811.2-201ENST00000585562 646 ntTSL 310.1□□□□□ -0.792e-6■■■□□ 14.6
GTF2F1P35269 RNF214-206ENST00000531452 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.812e-6■■■□□ 14.6
GTF2F1P35269 NCAM2-202ENST00000400546 8135 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.832e-6■■■□□ 14.6
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GTF2F1P35269 LARS-201ENST00000274562 2213 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.412e-6■■■□□ 14.6
GTF2F1P35269 RGS20-209ENST00000523280 1434 ntTSL 1 (best)6□□□□□ -1.452e-6■■■□□ 14.6
GTF2F1P35269 RGS20-205ENST00000517659 1518 ntTSL 1 (best)5.89□□□□□ -1.472e-6■■■□□ 14.6
GTF2F1P35269 VCL-203ENST00000461383 268 ntTSL 24.85□□□□□ -1.632e-6■■■□□ 14.6
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GTF2F1P35269 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.922e-8■■■□□ 14.6
GTF2F1P35269 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.832e-8■■■□□ 14.6
GTF2F1P35269 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.792e-8■■■□□ 14.6
GTF2F1P35269 PABPC1L-211ENST00000476056 1214 ntTSL 513.26□□□□□ -0.292e-8■■■□□ 14.6
GTF2F1P35269 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.121e-6■■■□□ 14.6
GTF2F1P35269 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.931e-6■■■□□ 14.6
GTF2F1P35269 KMT5A-209ENST00000537270 352 ntTSL 519.65■□□□□ 0.741e-6■■■□□ 14.6
GTF2F1P35269 KMT5A-204ENST00000437519 1774 ntTSL 213.9□□□□□ -0.181e-6■■■□□ 14.6
GTF2F1P35269 BBC3-206ENST00000601438 1747 nt20.01■□□□□ 0.794e-13■■■□□ 14.6
GTF2F1P35269 ETS2-203ENST00000432278 1033 ntTSL 521.82■■□□□ 1.084e-10■■■□□ 14.6
GTF2F1P35269 ETS2-201ENST00000360214 3936 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.064e-10■■■□□ 14.6
GTF2F1P35269 ETS2-202ENST00000360938 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.234e-10■■■□□ 14.6
GTF2F1P35269 ROCK2-204ENST00000431087 729 ntTSL 38.46□□□□□ -1.064e-10■■■□□ 14.6
GTF2F1P35269 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.252e-7■■■□□ 14.6
GTF2F1P35269 FGFRL1-202ENST00000398484 3639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.012e-7■■■□□ 14.6
GTF2F1P35269 CHID1-216ENST00000529539 602 ntTSL 223.71■■□□□ 1.395e-7■■□□□ 14.5
GTF2F1P35269 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.385e-7■■□□□ 14.5
GTF2F1P35269 PACSIN3-209ENST00000532457 1845 ntTSL 522.92■■□□□ 1.265e-7■■□□□ 14.5
GTF2F1P35269 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.235e-7■■□□□ 14.5
GTF2F1P35269 CYP27A1-205ENST00000494263 2566 ntTSL 221.57■■□□□ 1.045e-7■■□□□ 14.5
GTF2F1P35269 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.045e-7■■□□□ 14.5
GTF2F1P35269 CHID1-220ENST00000532909 619 ntTSL 521.37■■□□□ 1.015e-7■■□□□ 14.5
GTF2F1P35269 CLUH-211ENST00000575014 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 520■□□□□ 0.795e-7■■□□□ 14.5
GTF2F1P35269 CHID1-223ENST00000534207 1171 ntTSL 519.04■□□□□ 0.645e-7■■□□□ 14.5
GTF2F1P35269 PYGB-202ENST00000428458 734 ntTSL 313.13□□□□□ -0.315e-7■■□□□ 14.5
GTF2F1P35269 PYGB-201ENST00000216962 4134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.555e-7■■□□□ 14.5
GTF2F1P35269 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.175e-8■■□□□ 14.5
GTF2F1P35269 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.045e-8■■□□□ 14.5
GTF2F1P35269 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.965e-8■■□□□ 14.5
GTF2F1P35269 LTBP4-223ENST00000598717 811 ntTSL 520.27■□□□□ 0.846e-7■■□□□ 14.5
GTF2F1P35269 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.625e-8■■□□□ 14.5
GTF2F1P35269 CD55-211ENST00000635614 1145 ntTSL 511.43□□□□□ -0.585e-8■■□□□ 14.5
GTF2F1P35269 CD55-210ENST00000634386 951 ntTSL 57.95□□□□□ -1.145e-8■■□□□ 14.5
GTF2F1P35269 CD55-208ENST00000476590 2163 ntTSL 1 (best)5.09□□□□□ -1.595e-8■■□□□ 14.5
GTF2F1P35269 CD55-207ENST00000465534 1480 ntTSL 1 (best)3.87□□□□□ -1.795e-8■■□□□ 14.5
GTF2F1P35269 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.579e-7■■□□□ 14.5
GTF2F1P35269 SCAF1-203ENST00000598359 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 315.41■□□□□ 0.069e-7■■□□□ 14.5
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