Protein–RNA interactions for Protein: P28562

DUSP1, Dual specificity protein phosphatase 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP1P28562 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
DUSP1P28562 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
DUSP1P28562 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
DUSP1P28562 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
DUSP1P28562 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
DUSP1P28562 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
DUSP1P28562 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
DUSP1P28562 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
DUSP1P28562 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
DUSP1P28562 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
DUSP1P28562 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
DUSP1P28562 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
DUSP1P28562 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
DUSP1P28562 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
DUSP1P28562 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
DUSP1P28562 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
DUSP1P28562 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
DUSP1P28562 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
DUSP1P28562 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
DUSP1P28562 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
DUSP1P28562 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
DUSP1P28562 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
DUSP1P28562 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
DUSP1P28562 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
DUSP1P28562 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
DUSP1P28562 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
DUSP1P28562 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
DUSP1P28562 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
DUSP1P28562 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
DUSP1P28562 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
DUSP1P28562 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
DUSP1P28562 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
DUSP1P28562 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
DUSP1P28562 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
DUSP1P28562 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
DUSP1P28562 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
DUSP1P28562 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
DUSP1P28562 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
DUSP1P28562 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
DUSP1P28562 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
DUSP1P28562 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
DUSP1P28562 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
DUSP1P28562 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
DUSP1P28562 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
DUSP1P28562 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
DUSP1P28562 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
DUSP1P28562 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
DUSP1P28562 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
DUSP1P28562 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
DUSP1P28562 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
DUSP1P28562 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
DUSP1P28562 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
DUSP1P28562 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
DUSP1P28562 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
DUSP1P28562 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
DUSP1P28562 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
DUSP1P28562 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
DUSP1P28562 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
DUSP1P28562 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
DUSP1P28562 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
DUSP1P28562 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
DUSP1P28562 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
DUSP1P28562 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
DUSP1P28562 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
DUSP1P28562 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
DUSP1P28562 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
DUSP1P28562 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
DUSP1P28562 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
DUSP1P28562 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
DUSP1P28562 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
DUSP1P28562 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
DUSP1P28562 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
DUSP1P28562 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
DUSP1P28562 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
DUSP1P28562 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
DUSP1P28562 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
DUSP1P28562 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
DUSP1P28562 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
DUSP1P28562 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
DUSP1P28562 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
DUSP1P28562 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
DUSP1P28562 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
DUSP1P28562 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
DUSP1P28562 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
DUSP1P28562 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
DUSP1P28562 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
DUSP1P28562 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
DUSP1P28562 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
DUSP1P28562 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
DUSP1P28562 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
DUSP1P28562 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
DUSP1P28562 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
DUSP1P28562 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
DUSP1P28562 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
DUSP1P28562 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
DUSP1P28562 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
DUSP1P28562 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
DUSP1P28562 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
DUSP1P28562 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
DUSP1P28562 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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