Protein–RNA interactions for Protein: P12271

RLBP1, Retinaldehyde-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLBP1P12271 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RLBP1P12271 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RLBP1P12271 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RLBP1P12271 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RLBP1P12271 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
RLBP1P12271 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RLBP1P12271 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
RLBP1P12271 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RLBP1P12271 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RLBP1P12271 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RLBP1P12271 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RLBP1P12271 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RLBP1P12271 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RLBP1P12271 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RLBP1P12271 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RLBP1P12271 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
RLBP1P12271 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
RLBP1P12271 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RLBP1P12271 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RLBP1P12271 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RLBP1P12271 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RLBP1P12271 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RLBP1P12271 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RLBP1P12271 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RLBP1P12271 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RLBP1P12271 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RLBP1P12271 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RLBP1P12271 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RLBP1P12271 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RLBP1P12271 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RLBP1P12271 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RLBP1P12271 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RLBP1P12271 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RLBP1P12271 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RLBP1P12271 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RLBP1P12271 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RLBP1P12271 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RLBP1P12271 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RLBP1P12271 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RLBP1P12271 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RLBP1P12271 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RLBP1P12271 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RLBP1P12271 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RLBP1P12271 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RLBP1P12271 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
RLBP1P12271 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RLBP1P12271 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RLBP1P12271 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RLBP1P12271 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
RLBP1P12271 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RLBP1P12271 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RLBP1P12271 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RLBP1P12271 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
RLBP1P12271 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RLBP1P12271 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RLBP1P12271 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RLBP1P12271 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RLBP1P12271 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RLBP1P12271 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RLBP1P12271 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RLBP1P12271 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RLBP1P12271 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RLBP1P12271 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
RLBP1P12271 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RLBP1P12271 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RLBP1P12271 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
RLBP1P12271 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RLBP1P12271 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RLBP1P12271 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RLBP1P12271 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RLBP1P12271 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RLBP1P12271 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RLBP1P12271 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RLBP1P12271 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RLBP1P12271 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RLBP1P12271 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RLBP1P12271 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RLBP1P12271 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
RLBP1P12271 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
RLBP1P12271 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
RLBP1P12271 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RLBP1P12271 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RLBP1P12271 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
RLBP1P12271 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RLBP1P12271 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RLBP1P12271 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RLBP1P12271 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RLBP1P12271 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RLBP1P12271 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RLBP1P12271 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RLBP1P12271 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RLBP1P12271 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RLBP1P12271 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RLBP1P12271 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RLBP1P12271 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RLBP1P12271 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RLBP1P12271 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RLBP1P12271 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RLBP1P12271 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RLBP1P12271 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms