Protein–RNA interactions for Protein: P0C7I6

CCDC159, Coiled-coil domain-containing protein 159, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC159P0C7I6 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC159P0C7I6 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC159P0C7I6 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC159P0C7I6 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC159P0C7I6 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC159P0C7I6 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC159P0C7I6 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC159P0C7I6 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC159P0C7I6 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC159P0C7I6 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC159P0C7I6 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC159P0C7I6 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC159P0C7I6 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC159P0C7I6 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC159P0C7I6 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC159P0C7I6 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC159P0C7I6 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC159P0C7I6 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC159P0C7I6 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC159P0C7I6 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC159P0C7I6 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC159P0C7I6 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC159P0C7I6 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC159P0C7I6 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC159P0C7I6 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC159P0C7I6 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC159P0C7I6 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC159P0C7I6 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC159P0C7I6 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC159P0C7I6 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC159P0C7I6 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC159P0C7I6 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC159P0C7I6 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC159P0C7I6 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC159P0C7I6 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC159P0C7I6 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC159P0C7I6 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC159P0C7I6 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC159P0C7I6 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC159P0C7I6 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC159P0C7I6 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC159P0C7I6 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC159P0C7I6 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC159P0C7I6 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC159P0C7I6 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC159P0C7I6 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC159P0C7I6 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC159P0C7I6 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC159P0C7I6 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC159P0C7I6 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC159P0C7I6 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC159P0C7I6 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC159P0C7I6 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC159P0C7I6 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC159P0C7I6 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC159P0C7I6 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC159P0C7I6 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC159P0C7I6 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC159P0C7I6 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC159P0C7I6 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC159P0C7I6 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC159P0C7I6 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC159P0C7I6 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC159P0C7I6 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC159P0C7I6 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC159P0C7I6 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC159P0C7I6 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC159P0C7I6 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC159P0C7I6 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC159P0C7I6 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC159P0C7I6 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC159P0C7I6 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC159P0C7I6 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC159P0C7I6 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC159P0C7I6 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC159P0C7I6 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC159P0C7I6 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC159P0C7I6 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC159P0C7I6 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC159P0C7I6 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC159P0C7I6 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC159P0C7I6 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC159P0C7I6 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC159P0C7I6 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC159P0C7I6 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC159P0C7I6 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC159P0C7I6 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC159P0C7I6 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC159P0C7I6 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC159P0C7I6 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC159P0C7I6 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC159P0C7I6 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC159P0C7I6 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC159P0C7I6 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC159P0C7I6 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC159P0C7I6 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC159P0C7I6 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC159P0C7I6 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC159P0C7I6 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC159P0C7I6 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms