Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SNX13Q9Y5W8 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SNX13Q9Y5W8 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX13Q9Y5W8 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX13Q9Y5W8 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX13Q9Y5W8 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX13Q9Y5W8 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX13Q9Y5W8 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX13Q9Y5W8 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX13Q9Y5W8 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX13Q9Y5W8 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX13Q9Y5W8 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX13Q9Y5W8 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX13Q9Y5W8 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX13Q9Y5W8 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX13Q9Y5W8 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX13Q9Y5W8 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX13Q9Y5W8 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX13Q9Y5W8 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX13Q9Y5W8 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX13Q9Y5W8 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX13Q9Y5W8 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX13Q9Y5W8 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX13Q9Y5W8 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX13Q9Y5W8 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX13Q9Y5W8 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX13Q9Y5W8 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX13Q9Y5W8 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX13Q9Y5W8 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX13Q9Y5W8 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX13Q9Y5W8 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX13Q9Y5W8 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX13Q9Y5W8 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX13Q9Y5W8 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX13Q9Y5W8 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX13Q9Y5W8 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX13Q9Y5W8 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX13Q9Y5W8 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX13Q9Y5W8 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX13Q9Y5W8 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX13Q9Y5W8 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX13Q9Y5W8 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX13Q9Y5W8 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX13Q9Y5W8 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX13Q9Y5W8 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX13Q9Y5W8 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX13Q9Y5W8 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX13Q9Y5W8 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX13Q9Y5W8 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX13Q9Y5W8 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX13Q9Y5W8 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX13Q9Y5W8 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX13Q9Y5W8 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX13Q9Y5W8 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX13Q9Y5W8 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX13Q9Y5W8 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX13Q9Y5W8 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX13Q9Y5W8 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX13Q9Y5W8 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX13Q9Y5W8 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX13Q9Y5W8 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX13Q9Y5W8 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX13Q9Y5W8 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX13Q9Y5W8 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX13Q9Y5W8 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX13Q9Y5W8 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX13Q9Y5W8 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX13Q9Y5W8 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX13Q9Y5W8 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX13Q9Y5W8 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX13Q9Y5W8 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX13Q9Y5W8 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX13Q9Y5W8 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX13Q9Y5W8 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX13Q9Y5W8 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX13Q9Y5W8 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX13Q9Y5W8 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX13Q9Y5W8 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX13Q9Y5W8 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX13Q9Y5W8 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX13Q9Y5W8 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX13Q9Y5W8 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX13Q9Y5W8 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX13Q9Y5W8 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX13Q9Y5W8 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX13Q9Y5W8 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX13Q9Y5W8 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX13Q9Y5W8 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX13Q9Y5W8 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX13Q9Y5W8 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX13Q9Y5W8 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX13Q9Y5W8 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX13Q9Y5W8 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX13Q9Y5W8 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX13Q9Y5W8 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX13Q9Y5W8 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX13Q9Y5W8 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX13Q9Y5W8 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX13Q9Y5W8 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX13Q9Y5W8 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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