Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8I0

SAMD12, Sterile alpha motif domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD12Q8N8I0 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SAMD12Q8N8I0 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SAMD12Q8N8I0 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SAMD12Q8N8I0 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SAMD12Q8N8I0 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SAMD12Q8N8I0 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SAMD12Q8N8I0 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SAMD12Q8N8I0 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SAMD12Q8N8I0 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SAMD12Q8N8I0 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SAMD12Q8N8I0 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SAMD12Q8N8I0 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SAMD12Q8N8I0 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SAMD12Q8N8I0 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SAMD12Q8N8I0 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SAMD12Q8N8I0 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SAMD12Q8N8I0 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SAMD12Q8N8I0 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SAMD12Q8N8I0 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SAMD12Q8N8I0 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SAMD12Q8N8I0 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SAMD12Q8N8I0 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SAMD12Q8N8I0 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SAMD12Q8N8I0 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SAMD12Q8N8I0 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SAMD12Q8N8I0 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SAMD12Q8N8I0 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SAMD12Q8N8I0 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SAMD12Q8N8I0 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SAMD12Q8N8I0 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SAMD12Q8N8I0 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SAMD12Q8N8I0 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SAMD12Q8N8I0 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SAMD12Q8N8I0 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SAMD12Q8N8I0 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SAMD12Q8N8I0 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SAMD12Q8N8I0 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SAMD12Q8N8I0 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SAMD12Q8N8I0 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SAMD12Q8N8I0 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SAMD12Q8N8I0 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SAMD12Q8N8I0 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SAMD12Q8N8I0 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SAMD12Q8N8I0 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SAMD12Q8N8I0 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SAMD12Q8N8I0 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SAMD12Q8N8I0 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SAMD12Q8N8I0 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SAMD12Q8N8I0 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SAMD12Q8N8I0 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SAMD12Q8N8I0 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SAMD12Q8N8I0 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SAMD12Q8N8I0 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SAMD12Q8N8I0 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SAMD12Q8N8I0 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SAMD12Q8N8I0 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SAMD12Q8N8I0 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SAMD12Q8N8I0 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SAMD12Q8N8I0 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SAMD12Q8N8I0 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SAMD12Q8N8I0 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SAMD12Q8N8I0 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SAMD12Q8N8I0 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SAMD12Q8N8I0 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SAMD12Q8N8I0 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SAMD12Q8N8I0 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SAMD12Q8N8I0 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SAMD12Q8N8I0 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SAMD12Q8N8I0 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SAMD12Q8N8I0 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SAMD12Q8N8I0 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SAMD12Q8N8I0 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SAMD12Q8N8I0 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SAMD12Q8N8I0 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SAMD12Q8N8I0 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SAMD12Q8N8I0 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SAMD12Q8N8I0 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SAMD12Q8N8I0 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SAMD12Q8N8I0 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SAMD12Q8N8I0 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SAMD12Q8N8I0 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SAMD12Q8N8I0 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SAMD12Q8N8I0 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SAMD12Q8N8I0 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SAMD12Q8N8I0 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SAMD12Q8N8I0 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SAMD12Q8N8I0 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SAMD12Q8N8I0 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SAMD12Q8N8I0 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SAMD12Q8N8I0 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SAMD12Q8N8I0 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SAMD12Q8N8I0 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SAMD12Q8N8I0 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SAMD12Q8N8I0 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SAMD12Q8N8I0 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SAMD12Q8N8I0 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SAMD12Q8N8I0 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SAMD12Q8N8I0 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SAMD12Q8N8I0 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SAMD12Q8N8I0 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.1 ms