Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT16

SLC18B1, MFS-type transporter SLC18B1, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18B1Q6NT16 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC18B1Q6NT16 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC18B1Q6NT16 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC18B1Q6NT16 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC18B1Q6NT16 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC18B1Q6NT16 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC18B1Q6NT16 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC18B1Q6NT16 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC18B1Q6NT16 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC18B1Q6NT16 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC18B1Q6NT16 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC18B1Q6NT16 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC18B1Q6NT16 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC18B1Q6NT16 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC18B1Q6NT16 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC18B1Q6NT16 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC18B1Q6NT16 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC18B1Q6NT16 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC18B1Q6NT16 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC18B1Q6NT16 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC18B1Q6NT16 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC18B1Q6NT16 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC18B1Q6NT16 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC18B1Q6NT16 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC18B1Q6NT16 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC18B1Q6NT16 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC18B1Q6NT16 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC18B1Q6NT16 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC18B1Q6NT16 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC18B1Q6NT16 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC18B1Q6NT16 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC18B1Q6NT16 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC18B1Q6NT16 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC18B1Q6NT16 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC18B1Q6NT16 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC18B1Q6NT16 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC18B1Q6NT16 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC18B1Q6NT16 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC18B1Q6NT16 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC18B1Q6NT16 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC18B1Q6NT16 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC18B1Q6NT16 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC18B1Q6NT16 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC18B1Q6NT16 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC18B1Q6NT16 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC18B1Q6NT16 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC18B1Q6NT16 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC18B1Q6NT16 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC18B1Q6NT16 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC18B1Q6NT16 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC18B1Q6NT16 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC18B1Q6NT16 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC18B1Q6NT16 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC18B1Q6NT16 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC18B1Q6NT16 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC18B1Q6NT16 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC18B1Q6NT16 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC18B1Q6NT16 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC18B1Q6NT16 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC18B1Q6NT16 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC18B1Q6NT16 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC18B1Q6NT16 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC18B1Q6NT16 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC18B1Q6NT16 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC18B1Q6NT16 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC18B1Q6NT16 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC18B1Q6NT16 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC18B1Q6NT16 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC18B1Q6NT16 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC18B1Q6NT16 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC18B1Q6NT16 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC18B1Q6NT16 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC18B1Q6NT16 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC18B1Q6NT16 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC18B1Q6NT16 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC18B1Q6NT16 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC18B1Q6NT16 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC18B1Q6NT16 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC18B1Q6NT16 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC18B1Q6NT16 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC18B1Q6NT16 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC18B1Q6NT16 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC18B1Q6NT16 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC18B1Q6NT16 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC18B1Q6NT16 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC18B1Q6NT16 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC18B1Q6NT16 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC18B1Q6NT16 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC18B1Q6NT16 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC18B1Q6NT16 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC18B1Q6NT16 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC18B1Q6NT16 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC18B1Q6NT16 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC18B1Q6NT16 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC18B1Q6NT16 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC18B1Q6NT16 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC18B1Q6NT16 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC18B1Q6NT16 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC18B1Q6NT16 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC18B1Q6NT16 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms