Protein–RNA interactions for Protein: Q5SXM2

SNAPC4, snRNA-activating protein complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC4Q5SXM2 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SNAPC4Q5SXM2 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SNAPC4Q5SXM2 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SNAPC4Q5SXM2 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SNAPC4Q5SXM2 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SNAPC4Q5SXM2 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SNAPC4Q5SXM2 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SNAPC4Q5SXM2 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SNAPC4Q5SXM2 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SNAPC4Q5SXM2 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
SNAPC4Q5SXM2 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
SNAPC4Q5SXM2 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SNAPC4Q5SXM2 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SNAPC4Q5SXM2 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SNAPC4Q5SXM2 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SNAPC4Q5SXM2 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SNAPC4Q5SXM2 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SNAPC4Q5SXM2 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SNAPC4Q5SXM2 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
SNAPC4Q5SXM2 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SNAPC4Q5SXM2 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SNAPC4Q5SXM2 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SNAPC4Q5SXM2 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SNAPC4Q5SXM2 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SNAPC4Q5SXM2 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SNAPC4Q5SXM2 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SNAPC4Q5SXM2 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
SNAPC4Q5SXM2 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SNAPC4Q5SXM2 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SNAPC4Q5SXM2 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SNAPC4Q5SXM2 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SNAPC4Q5SXM2 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SNAPC4Q5SXM2 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SNAPC4Q5SXM2 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SNAPC4Q5SXM2 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SNAPC4Q5SXM2 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SNAPC4Q5SXM2 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SNAPC4Q5SXM2 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
SNAPC4Q5SXM2 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
SNAPC4Q5SXM2 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SNAPC4Q5SXM2 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SNAPC4Q5SXM2 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SNAPC4Q5SXM2 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SNAPC4Q5SXM2 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SNAPC4Q5SXM2 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SNAPC4Q5SXM2 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SNAPC4Q5SXM2 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SNAPC4Q5SXM2 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SNAPC4Q5SXM2 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SNAPC4Q5SXM2 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SNAPC4Q5SXM2 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SNAPC4Q5SXM2 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SNAPC4Q5SXM2 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SNAPC4Q5SXM2 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
SNAPC4Q5SXM2 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
SNAPC4Q5SXM2 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
SNAPC4Q5SXM2 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SNAPC4Q5SXM2 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SNAPC4Q5SXM2 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SNAPC4Q5SXM2 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SNAPC4Q5SXM2 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SNAPC4Q5SXM2 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SNAPC4Q5SXM2 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SNAPC4Q5SXM2 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SNAPC4Q5SXM2 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SNAPC4Q5SXM2 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SNAPC4Q5SXM2 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SNAPC4Q5SXM2 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SNAPC4Q5SXM2 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SNAPC4Q5SXM2 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SNAPC4Q5SXM2 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
SNAPC4Q5SXM2 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SNAPC4Q5SXM2 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SNAPC4Q5SXM2 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SNAPC4Q5SXM2 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SNAPC4Q5SXM2 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SNAPC4Q5SXM2 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SNAPC4Q5SXM2 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SNAPC4Q5SXM2 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SNAPC4Q5SXM2 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SNAPC4Q5SXM2 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SNAPC4Q5SXM2 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
SNAPC4Q5SXM2 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SNAPC4Q5SXM2 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
SNAPC4Q5SXM2 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SNAPC4Q5SXM2 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SNAPC4Q5SXM2 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SNAPC4Q5SXM2 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
SNAPC4Q5SXM2 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SNAPC4Q5SXM2 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SNAPC4Q5SXM2 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SNAPC4Q5SXM2 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SNAPC4Q5SXM2 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SNAPC4Q5SXM2 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SNAPC4Q5SXM2 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SNAPC4Q5SXM2 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SNAPC4Q5SXM2 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SNAPC4Q5SXM2 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SNAPC4Q5SXM2 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SNAPC4Q5SXM2 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms