Protein–RNA interactions for Protein: Q499Y3

Putative uncharacterized protein C10orf88-like, humanhuman

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Length 187 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q499Y3 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q499Y3 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q499Y3 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q499Y3 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q499Y3 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q499Y3 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q499Y3 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q499Y3 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q499Y3 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q499Y3 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q499Y3 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q499Y3 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q499Y3 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q499Y3 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q499Y3 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q499Y3 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q499Y3 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q499Y3 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q499Y3 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q499Y3 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Q499Y3 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q499Y3 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q499Y3 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Q499Y3 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q499Y3 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q499Y3 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Q499Y3 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q499Y3 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q499Y3 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q499Y3 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q499Y3 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q499Y3 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q499Y3 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Q499Y3 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q499Y3 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q499Y3 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q499Y3 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q499Y3 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q499Y3 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q499Y3 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q499Y3 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q499Y3 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q499Y3 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q499Y3 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q499Y3 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q499Y3 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q499Y3 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q499Y3 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q499Y3 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q499Y3 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q499Y3 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q499Y3 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q499Y3 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q499Y3 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q499Y3 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q499Y3 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q499Y3 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q499Y3 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q499Y3 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q499Y3 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q499Y3 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q499Y3 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q499Y3 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q499Y3 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q499Y3 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q499Y3 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Q499Y3 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Q499Y3 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q499Y3 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q499Y3 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q499Y3 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q499Y3 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q499Y3 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Q499Y3 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Q499Y3 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Q499Y3 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q499Y3 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q499Y3 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q499Y3 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q499Y3 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q499Y3 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q499Y3 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q499Y3 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q499Y3 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q499Y3 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q499Y3 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q499Y3 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q499Y3 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q499Y3 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q499Y3 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q499Y3 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q499Y3 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q499Y3 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q499Y3 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q499Y3 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q499Y3 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Q499Y3 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q499Y3 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q499Y3 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q499Y3 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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