Protein–RNA interactions for Protein: Q1T7F1

Putative chemokine-related protein B42, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q1T7F1 CLCN7-203ENST00000448525 4151 ntTSL 2 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Q1T7F1 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Q1T7F1 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Q1T7F1 DLX1-201ENST00000341900 2130 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Q1T7F1 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Q1T7F1 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Q1T7F1 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Q1T7F1 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Q1T7F1 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Q1T7F1 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Q1T7F1 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Q1T7F1 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Q1T7F1 CYB5D1-203ENST00000571846 1870 ntTSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Q1T7F1 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Q1T7F1 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Q1T7F1 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Q1T7F1 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Q1T7F1 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Q1T7F1 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Q1T7F1 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Q1T7F1 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Q1T7F1 CD300LB-202ENST00000392621 2286 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Q1T7F1 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Q1T7F1 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Q1T7F1 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Q1T7F1 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Q1T7F1 TRIB1-201ENST00000311922 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Q1T7F1 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Q1T7F1 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Q1T7F1 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Q1T7F1 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Q1T7F1 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Q1T7F1 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Q1T7F1 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Q1T7F1 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Q1T7F1 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Q1T7F1 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Q1T7F1 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Q1T7F1 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Q1T7F1 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Q1T7F1 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Q1T7F1 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Q1T7F1 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Q1T7F1 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Q1T7F1 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Q1T7F1 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Q1T7F1 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Q1T7F1 SLC5A9-210ENST00000533824 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Q1T7F1 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Q1T7F1 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.93
Q1T7F1 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Q1T7F1 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.93
Q1T7F1 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.21□□□□□ -0.93
Q1T7F1 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.93
Q1T7F1 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Q1T7F1 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Q1T7F1 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC9.21□□□□□ -0.93
Q1T7F1 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC9.21□□□□□ -0.93
Q1T7F1 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.93
Q1T7F1 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Q1T7F1 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.21□□□□□ -0.93
Q1T7F1 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Q1T7F1 GNG12-AS1-201ENST00000413628 2058 ntTSL 2 BASIC9.21□□□□□ -0.93
Q1T7F1 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Q1T7F1 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Q1T7F1 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC9.21□□□□□ -0.94
Q1T7F1 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
Q1T7F1 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
Q1T7F1 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Q1T7F1 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Q1T7F1 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Q1T7F1 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
Q1T7F1 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Q1T7F1 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Q1T7F1 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Q1T7F1 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
Q1T7F1 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Q1T7F1 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC9.21□□□□□ -0.94
Q1T7F1 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Q1T7F1 AOC4P-203ENST00000566825 2289 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
Q1T7F1 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.21□□□□□ -0.94
Q1T7F1 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.21□□□□□ -0.94
Q1T7F1 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Q1T7F1 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Q1T7F1 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Q1T7F1 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Q1T7F1 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
Q1T7F1 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Q1T7F1 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC9.21□□□□□ -0.94
Q1T7F1 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.21□□□□□ -0.94
Q1T7F1 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Q1T7F1 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Q1T7F1 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
Q1T7F1 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
Q1T7F1 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
Q1T7F1 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Q1T7F1 CDC45-205ENST00000437685 2072 ntTSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Q1T7F1 COX6B2-210ENST00000593184 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Q1T7F1 CEP131-201ENST00000269392 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Q1T7F1 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
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