Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SGCBQ16585 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SGCBQ16585 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SGCBQ16585 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SGCBQ16585 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SGCBQ16585 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SGCBQ16585 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SGCBQ16585 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SGCBQ16585 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SGCBQ16585 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SGCBQ16585 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SGCBQ16585 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SGCBQ16585 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SGCBQ16585 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SGCBQ16585 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SGCBQ16585 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SGCBQ16585 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SGCBQ16585 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SGCBQ16585 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SGCBQ16585 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SGCBQ16585 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SGCBQ16585 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SGCBQ16585 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SGCBQ16585 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SGCBQ16585 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SGCBQ16585 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SGCBQ16585 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SGCBQ16585 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SGCBQ16585 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SGCBQ16585 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SGCBQ16585 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SGCBQ16585 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SGCBQ16585 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SGCBQ16585 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SGCBQ16585 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SGCBQ16585 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SGCBQ16585 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SGCBQ16585 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SGCBQ16585 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SGCBQ16585 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SGCBQ16585 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SGCBQ16585 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SGCBQ16585 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SGCBQ16585 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SGCBQ16585 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SGCBQ16585 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SGCBQ16585 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SGCBQ16585 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SGCBQ16585 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SGCBQ16585 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SGCBQ16585 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SGCBQ16585 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SGCBQ16585 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
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