Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
BRD3Q15059 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
BRD3Q15059 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
BRD3Q15059 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BRD3Q15059 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
BRD3Q15059 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
BRD3Q15059 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BRD3Q15059 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BRD3Q15059 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
BRD3Q15059 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
BRD3Q15059 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BRD3Q15059 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BRD3Q15059 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
BRD3Q15059 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BRD3Q15059 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BRD3Q15059 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
BRD3Q15059 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BRD3Q15059 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
BRD3Q15059 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BRD3Q15059 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
BRD3Q15059 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
BRD3Q15059 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BRD3Q15059 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
BRD3Q15059 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BRD3Q15059 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
BRD3Q15059 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
BRD3Q15059 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
BRD3Q15059 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
BRD3Q15059 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
BRD3Q15059 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BRD3Q15059 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BRD3Q15059 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BRD3Q15059 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BRD3Q15059 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BRD3Q15059 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BRD3Q15059 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
BRD3Q15059 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BRD3Q15059 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BRD3Q15059 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BRD3Q15059 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
BRD3Q15059 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
BRD3Q15059 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
BRD3Q15059 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
BRD3Q15059 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BRD3Q15059 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BRD3Q15059 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BRD3Q15059 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
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BRD3Q15059 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
BRD3Q15059 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
BRD3Q15059 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
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BRD3Q15059 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
BRD3Q15059 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BRD3Q15059 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
BRD3Q15059 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BRD3Q15059 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
BRD3Q15059 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
BRD3Q15059 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
BRD3Q15059 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
BRD3Q15059 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
BRD3Q15059 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
BRD3Q15059 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
BRD3Q15059 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
BRD3Q15059 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
BRD3Q15059 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
BRD3Q15059 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
BRD3Q15059 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
BRD3Q15059 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
BRD3Q15059 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
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BRD3Q15059 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
BRD3Q15059 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
BRD3Q15059 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
BRD3Q15059 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
BRD3Q15059 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
BRD3Q15059 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
BRD3Q15059 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
BRD3Q15059 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
BRD3Q15059 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
BRD3Q15059 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
BRD3Q15059 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
BRD3Q15059 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
BRD3Q15059 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BRD3Q15059 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BRD3Q15059 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BRD3Q15059 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BRD3Q15059 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
BRD3Q15059 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
BRD3Q15059 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BRD3Q15059 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BRD3Q15059 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
BRD3Q15059 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BRD3Q15059 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BRD3Q15059 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BRD3Q15059 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
BRD3Q15059 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
BRD3Q15059 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
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